Genetska struktura M3S populacije kukuruza pod rekurentnom selekcijom

Autor: Hrvoje Šarčević, Ivan Pejić, Marijana Barić, Bukan, Miroslav, Buhiniček, Ivica, Palaveršić, Branko, Sabljo, Ana, Kozumplik, Vinko
Přispěvatelé: Marić, Sonja, Lončarić, Sonja
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2009
Předmět:
Popis: U populaciji kukuruza Maksimir 3 Sintetik (M3S), stvorenoj međukrižanjem 12 domaćih inbred linija, završena su dva ciklusa rekurentne selekcije na prinos zrna na osnovi ocjene potomstava iz samooplodnje. Radi procjene promjena u genetskoj strukturi populacije uslijed selekcije po 96 individua iz osnovne populacije (C0) kao i 96 individua iz selekcijom poboljšane populacije (C2) analizirano je na devet mikrosatelitnih (simple sequence repeats, SSR) lokusa raspoređenih na sedam kromosoma kukuruza. Prosječna genska raznolikost ili očekivana heterozigotnost smanjila se od 0, 57 u C0 na 0, 45 u C2, rezultirajući u interpopulacijskom inbriding koeficijentu od 0, 15. Većina lokusa je bila u Hardy-Weinbergovoj ravnoteži (HWE). Signifikantno odstupanja od HWE proporcija u pravcu viška homozigota zapaženo je na jednom lokusu u C0 te na dva lokusa u C2 od ukupno devet ispitanih SSR lokusa. Od ukupno 36 pari lokusa tri para u C0 i jedan par u C2 su uključivali alele, koji su bili u signifikantnoj neravnoteži gametne faze (linkage disequilibrium, LD). Od sedam signifikantnih LD testova u C0 pet testova se odnosilo na alele s vezanih lokusa. Nakon dva ciklusa selekcije LD prisutan kod parova lokusa u C0 je nestao, a u C2 se pojavio LD kod jednog para alela s dva nevezana lokusa.
Databáze: OpenAIRE