| Autor: |
Samaržija, Ivana, Šeruga Musić, Martina |
| Přispěvatelé: |
Kružić, Petar, Caput Mihalić, Katarina, Gottstein, Sanja, Pavoković, Dubravko, Kučinić, Mladen |
| Jazyk: |
chorvatština |
| Rok vydání: |
2018 |
| Předmět: |
|
| Popis: |
Rod 'Candidatus Phytoplasma' obuhvaća unutarstanične bakterije bez stanične stijenke koje žive unutar biljnog floema i u stanicama kukaca koji su ujedno i njihovi prirodni vektori. Taksonomski, fitoplazme pripadaju razredu Mollicutes zajedno s aholeplazmama, mikoplazmama i srodnim bakterijama, a za razliku od spomenutih bakterija, nije ih moguće uzgajati u čistoj kulturi in vitro. Jedna od glavnih karakteristika njihovih malih i reduciranih genoma jest postojanje potencijalnih mobilnih jedinica (potential mobile units ; PMUs), genetičkih elemenata nalik transpozonima za koje se smatra da imaju ulogu u prilagodbi domaćinu. Replisomski geni, dnaB, dnaG i ssb, često se nalaze na takvim dijelovima genoma. U ovom radu izvršili smo opsežnu filogenetičku analizu DnaB, DnaG i SSB proteinskih sekvenci unutar članova razreda Mollicutes. Rezultati upućuju na složeno evolucijsko podrijetlo fitoplazmatskih replisomskih proteina s potencijalnih mobilnih jedinica. Analize sekvenci proteina DnaB pokazale su jasnu podjelu na dva klastera: DnaB1 i DnaB2, s dodatnim razdvajanjem PMU i ne-PMU sekvenci unutar DnaB1 klastera. Grupiranje sekvenci podrijetlom s PMU u zaseban klaster potvrđeno je i kod proteina DnaG i SSB. Dobiveni rezultati ukazuju na razdvojenu evoluciju PMU i ne-PMU replisomskih sekvenci, te česte rekombinacije i miješanje PMU gena između različitih fitoplazmatskih vrsta, što ovim bakterijama omogućava bolju prilagodbu i opstanak u različitim životnim uvjetima. |
| Databáze: |
OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|
