Caracterización molecular del síndrome respiratorio y reproductivo porcino (PRRS) del gen de la nucleocápside ORF 7 en granjas porcinas de Lima, Perú

Autor: Cotaquispe Nalvarte, Rony, De la Cruz Vásquez, Edgard, Quispe Cerón, Edwin, Sitaras, Nicholas, Toskano Hurtado, Jennifer
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 33 No. 6 (2022); e21638
Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 33 Núm. 6 (2022); e21638
ISSN: 1609-9117
1682-3419
Popis: The Betaarterivirus suid 1 and Betaarterivirus suid 2 species of the Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) virus cause severe outbreaks due to genetic recombination with high epidemiological risk, which requires rapid identification for efficient molecular epidemiological surveillance. The objectives of the study were the analysis of the gene that synthesizes the nucleocapsid proteins (ORF 7), as well as to determine the phylogenetic relationships with specific primers. Molecular characterization was performed and 24 positive isolates of the Betaarterivirus suid 2 species were identified. Ten isolates were genotyped, relating 8 of them to lineage 1: sublineage 1.5 with the representative variant NADC34 and 2 to lineage 5: sublineage 5.1 with the representative variant RespPRRS_MLV. In addition, the molecular homology test was performed with the DNAMAN program on the 10 isolates, obtaining 99% (8) and 87% (2) of similarity with the NADC34 variant, confirming the aforementioned. The phylogenetic relationship with the reported isolates and the results obtained indicate that at least 10 belonged to the Betaarterivirus suid 2 species through the nucleocapsid gene (ORF 7) with the research's own primers and the parental relationship of 8 isolates with lineage 1: sublineage 1.5 and 2 isolated with lineage 5: sublineage 5.1 of the species Betaarterivirus suid 2.
Las especies Betaarterivirus suid 1 y Betaarterivirus suid 2 2 del virus del Síndrome Reproductivo y Respiratorio Porcino (PRRS) ocasionan brotes severos debido a recombinaciones genéticas con alto riesgo epidemiológico, lo cual requiere de una rápida identificación para una eficiente vigilancia epidemiológica molecular. Los objetivos del estudio fueron el análisis del gen que sintetiza las proteínas de la nucleocápside (ORF 7), así como determinar las relaciones filogenéticas con cebadores específicos. Se realizó la caracterización molecular y se identificaron 24 aislados positivos de la especie Betaarterivirus suid 2. Se genotipificaron 10 aislados relacionando 8 de ellos al linaje 1: sublinaje 1.5 con la variante representativa NADC34 y 2 al linaje 5: sublinaje 5.1 con la variante representativa RespPRRS_MLV. Además, se realizó el test de homología molecular con el programa DNAMAN a los 10 aislados, obteniéndose 99% (8) y 87% (2) de similitud con la variante NADC34 confirmando lo antes mencionado. La relación filogenética con los aislados reportados y los resultados obtenidos indican que al menos 10 pertenecieron a la especie Betaarterivirus suid 2 mediante el gen de la nucleocápside (ORF 7) con los cebadores propios de la investigación y se confirmó la relación parental de 8 aislados con el linaje 1: sublinaje 1.5 y 2 aislados con el linaje 5: sublinaje 5.1 de la especie Betaarterivirus suid 2.
Databáze: OpenAIRE
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