Genotipificación por RAPD-PCR de aislados de Yersinia ruckeri procedentes de truchas arcoíris (Oncorhynchus mykiss) de la sierra del Perú

Autor: Mesías V., Fernando, Serrano-Martínez, Enrique, Llanco A., Luis
Jazyk: Spanish; Castilian
Rok vydání: 2020
Předmět:
Zdroj: Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol 30 No 4 (2019); 1743-1749
Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 30 Núm. 4 (2019); 1743-1749
ISSN: 1609-9117
1682-3419
Popis: The aim of this study was to identify Y. ruckeri genotypes, according to their origin, by RAPD-PCR. Aseptic samples of spleen and kidney were taken from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) with clinical signs of yersiniosis in fish farms of four departments (Junín, Lima, Ancash and Puno) of Peru. The strains were cultivated on trypticase soy agar at 25 °C for 24 hours and the presumptive identification of the colonies suspected of being Y. ruckeri was made by Gram stain and biochemical tests of oxidase and catalase. Then, the identity of Y. ruckeri was confirmed by PCR. In total, 63 isolates of Y. ruckeri were obtained and analyzed by RAPD-PCR. The dendogram of genetic diversity grouped all the isolates in one cluster, closely related to the control strain Y. ruckeri ATCC 29473 (96% similarity). It was also observed that all the isolates were genetically identical (clones). It is suggested that the strains could have a common origin because they had different geographical origins and high similarity between them.
El objetivo del presente estudio fue identificar genotipos de Y. ruckeri, según su procedencia, mediante RAPD-PCR. Se tomaron muestras asépticas de bazo y riñón de truchas arcoíris (Oncorhynchus mykiss) con signos clínicos de yersiniosis, provenientes de piscigranjas de cuatro departamentos (Junín, Lima, Ancash y Puno) del Perú. Las cepas fueron cultivadas en agar tripticasa de soya a 25°C por 24 horas y la identificación presuntiva de las colonias sospechosas de corresponder a Y. ruckeri se hizo mediante tinción Gram y pruebas bioquímicas de oxidasa y catalasa. Luego, se confirmó la identidad de Y. ruckeri por PCR. Se obtuvieron 63 aislados de Y. ruckeri y se analizaron mediante RAPD-PCR. El dendograma de diversidad genética agrupó a todos los aislados en un clúster, estrechamente relacionadas con la cepa control Y. ruckeri ATCC 29473 (96% de similitud). También se observó que todos los aislados eran genéticamente idénticos (clones). Se sugiere que las cepas podrían tener un origen común debido a que tuvieron diferentes procedencias geográficas y elevada similitud entre ellos.
Databáze: OpenAIRE
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