A Comparative Analysis of Innate Immune Responses and the Structural Characterization of Spike from SARS-CoV-2 Gamma Variants and Subvariants.

Autor: Scovino AM; Instituto de Microbiologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil.; Laboratório de Imunoparasitologia, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Dahab EC; Instituto de Microbiologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil.; Laboratório de Imunoparasitologia, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Diniz-Lima I; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., de Senna Silveira E; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre 91501-970, Brazil., Barroso SPC; Laboratório de Biologia Molecular, Instituto de Pesquisa Biomédica, Hospital Naval Marcílio Dias, Marinha do Brazil, Rio de Janeiro 20725-090, Brazil.; Biomanguinhos, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-900, Brazil., Cardoso KM; Laboratório de Biologia Molecular, Instituto de Pesquisa Biomédica, Hospital Naval Marcílio Dias, Marinha do Brazil, Rio de Janeiro 20725-090, Brazil., Nico D; Instituto de Microbiologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., Makhoul GJ; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., da Silva-Junior EB; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., Freire-de-Lima CG; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., Freire-de-Lima L; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil., Fonseca LMD; Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-902, Brazil.; Curso de Medicina, Universidade Castelo Branco (UCB), Rio de Janeiro 21710-255, Brazil., Valente N; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Nacife V; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Machado A; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Araújo M; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Vieira GF; Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre 91501-970, Brazil.; PPGSDH-Programa de Pós-Graduação em Saúde e Desenvolvimento Humano, Universidade La Salle, Canoas 92010-000, Brazil., Pauvolid-Corrêa A; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil.; Department of Veterinary Integrative Biosciences, Texas A&M University, College Station, TX 77843, USA.; Laboratório de Virologia Veterinária de Viçosa, Departamento de Veterinária, Universidade Federal de Viçosa, Viçosa 36570-900, Brazil., Siqueira M; Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo, COVID-19 National Reference Laboratory of Brazil and World Health Organization COVID-19 Reference Laboratory, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Morrot A; Laboratório de Imunoparasitologia, Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), Rio de Janeiro 21040-360, Brazil.; Escola de Medicina, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro 21941-909, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Microorganisms [Microorganisms] 2024 Apr 02; Vol. 12 (4). Date of Electronic Publication: 2024 Apr 02.
DOI: 10.3390/microorganisms12040720
Abstrakt: The SARS-CoV-2 P.1 variant, responsible for an outbreak in Manaus, Brazil, is distinguished by 12 amino acid differences in the S protein, potentially increasing its ACE-2 affinity and immune evasion capability. We investigated the innate immune response of this variant compared to the original B.1 strain, particularly concerning cytokine production. Blood samples from three severe COVID-19 patients were analyzed post-infection with both strains. Results showed no significant difference in cytokine production of mononuclear cells and neutrophils for either variant. While B.1 had higher cytopathogenicity, neither showed viral replication in mononuclear cells. Structural analyses of the S protein highlighted physicochemical variations, which might be linked to the differences in infectivity between the strains. Our studies point to the increased infectivity of P.1 could stem from altered immunogenicity and receptor-binding affinity.
Databáze: MEDLINE