Multiple introductions and country-wide spread of DENV-2 genotype II (Cosmopolitan) in Brazil.

Autor:	Gräf T; Laboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba 81350-010, Brazil., Ferreira CDN; Laboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba 81350-010, Brazil., de Lima GB; Núcleo de Plataformas Tecnológicas (NPT), Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil., de Lima RE; Núcleo de Plataformas Tecnológicas (NPT), Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil., Machado LC; Departamento de Entomologia, Instituto Aggeu Magalhães (IAM)-Fundação Oswaldo Cruz-FIOCRUZ, Recife, Pernambuco 50670-420, Brazil.; Núcleo de Bioinformática (NBI), Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil., Campos TL; Núcleo de Bioinformática (NBI), Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil., Schemberger MO; Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba 81350-010, Brazil., Faoro H; Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba 81350-010, Brazil., Paiva MHS; Núcleo de Ciências da Vida, Universidade Federal de Pernambuco (UFPE), Centro Acadêmico do Agreste-Rodovia BR-104, km 59-Nova Caruaru, Caruaru 55002-970, Brazil., Bezerra MF; Departamento de Microbiologia, Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil., Nascimento V; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., Souza V; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., Nascimento F; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., Mejía M; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., Silva D; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., de Oliveira YS; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil., Gonçalves L; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil.; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas-Dra Rosemary Costa Pinto, Manaus, Amazonas 69093-018, Brazil., Ramos TCA; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas-Dra Rosemary Costa Pinto, Manaus, Amazonas 69093-018, Brazil., de Castro DB; Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas-Dra Rosemary Costa Pinto, Manaus, Amazonas 69093-018, Brazil., Arcanjo AR; Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas (LACEN-AM), Manaus, Amazonas 69020-040, Brazil., Dantas HAP; Laboratório de Fronteira de Tabatinga (LAFRON-AM), Tabatinga, Amazonas 69640-000, Brazil., Presibella MM; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná (LACEN-PR), São José dos Pinhais, Paraná 83060-500, Brazil., Fernandes SB; Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina (LACEN-SC), Florianópolis, Santa Catarina 88010-001, Brazil., Gregianini TS; Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul (LACEN-RS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brazil., Paz E Silva KM; Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco (LACEN-PE), Recife, Pernambuco 50050-210, Brazil., Sacchi CT; Laboratorio Estrategico, Instituto Adolfo Lutz (IAL), Sao Paulo 01246-902, Brazil., Cruz ACR; Department of Arbovirology and Hemorrhagic Fevers, Evandro Chagas Institute, Health and Environment Surveillance Secretariat, Ministry of Health, Ananindeua, Para 670030-000, Brazil.; Institute of Biological Sciences, Federal University of Pará, Belém, Para 66075-110, Brazil., Duarte Dos Santos CN; Laboratório de Virologia Molecular, Instituto Carlos Chagas, Fundação Oswaldo Cruz, Curitiba 81350-010, Brazil., Bispo de Filippis AM; Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos, Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz, Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Bello G; Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos, Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz, Rio de Janeiro 21040-360, Brazil., Wallau GL; Departamento de Entomologia, Instituto Aggeu Magalhães (IAM)-Fundação Oswaldo Cruz-FIOCRUZ, Recife, Pernambuco 50670-420, Brazil.; Núcleo de Bioinformática (NBI), Instituto Aggeu Magalhães (IAM), FIOCRUZ-Pernambuco, Recife, Pernambuco 50740-465, Brazil.; Department of Arbovirology, Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine, WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research, National Reference Center for Tropical Infectious Diseases, Bernhard-Nocht-Straße 74, Hamburg 20359, Germany., Salvato RS; Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Sul (LACEN-RS), Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brazil., Naveca F; Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane, Fiocruz, Manaus 69057-070, Brazil.; Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos, Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz, Rio de Janeiro 21040-360, Brazil.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Virus evolution [Virus Evol] 2023 Sep 28; Vol. 9 (2), pp. vead059. Date of Electronic Publication: 2023 Sep 28 (Print Publication: 2023).
DOI:	10.1093/ve/vead059
Abstrakt:	Dengue virus serotype 2, genotype Cosmopolitan (DENV-2-GII), is one of the most widespread DENV strains globally. In the USA, DENV-2 epidemics have been dominated by DENV-2 genotype Asian-American (DENV-2-GIII), and the first cases of DENV-2-GII were only described in 2019, in Peru, and in 2021 in Brazil. To gain new information about the circulation of DENV-2-GII in Brazil, we sequenced 237 DENV-2 confirmed cases sampled between March 2021 and March 2023 and revealed that DENV-2-GII is already present in all geographic regions of Brazil. The phylogeographic analysis inferred that DENV-2-GII was introduced at least four times in Brazil, between May 2020 and August 2022, generating multiple clades that spread throughout the country with different success. Despite multiple introductions of DENV-2-GII, analysis of the country-wide laboratory surveillance data showed that the Brazilian dengue epidemic in 2022 was dominated by DENV-1 in most states. We hypothesize that massive circulation of DENV-2-GIII in previous years in Brazil might have created a population immune barrier against symptomatic homotypic reinfections by DENV-2-GII, leading to sustained cryptic circulation in asymptomatic cases and localized outbreaks of this new genotype. In summary, our study stresses the importance of arboviral genomic surveillance to close monitoring and better understanding the potential impact of DENV-2-GII in the coming years. Competing Interests: The authors report there are no competing interests to declare. (© The Author(s) 2023. Published by Oxford University Press.)
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