The imperative for quality control programs in Monkeypox virus DNA testing by PCR: CIBERINFEC quality control.

Autor: de Salazar A; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario San Cecilio, Granada, Spain.; Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs.Granada, Granada, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain., Martínez MJ; Servicio de Microbiología, Hospital Clinic de Barcelona, Spain.; Instituto de Salud Global de Barcelona (ISGloba), Barcelona, Spain., Navero-Castillejos J; Servicio de Microbiología, Hospital Clinic de Barcelona, Spain., Negredo A; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain.; Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain., Galán JC; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Ramón y Cajal, Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS), Madrid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain., Rojo Molinero E; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain.; Departamento de Microbiología, Hospital Universitario Son Espases, Health Research Institute of Balearic Islands (IdISBa), Palma, Spain., Lagarejos E; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario de Gran Canaria Dr. Negrín, Las Palmas de Gran Canaria, Spain., Muñoz-Almagro C; Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.; RDI Microbiology Department, Hospital Sant Joan de Deu, Barcelona, Spain.; Departamento de Medicina, School of Medicine, Universitat Internacional de Catalunya, Barcelona, Spain., Hernández Rodríguez Á; Laboratori Clínic de la Metropolitana Nord, Servei de Microbiologia, Hospital Universitari Germans Trias i Pujol, Badalona, Spain., Lepe JA; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain.; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Parasitología, Hospital Universitario Virgen del Rocio, Sevilla, Spain.; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS), Sevilla, Spain., Antón Pagarolas A; Departamento de Microbiología, Hospital Universitari Vall d'Hebron, PROSICS Barcelona, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain., Pérez Castro S; Servicio Microbiología, Complexo Hospitalario Universitario de Vigo, Vigo, Spain., Zamora Cintas MI; Servicio de Microbiología, Hospital Central de la Defensa 'Gómez-Ulla', Madrid, Spain., Domínguez-Gil González M; Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain.; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Río Hortega, Valladolid, Spain., Niubó-Bosch J; Laboratori Clínic Territorial Metropolitana Sud, Departamento de Microbiología, Hospital Universitari de Bellvitge, Institut Català de la Salut (ICS), Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL), L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Gutiérrez Arroyo A; Servicio de Microbiología Clínica, Hospital Universitario La Paz, Madrid, Spain., Vazquez A; Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red en Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), Madrid, Spain., García F; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario San Cecilio, Granada, Spain.; Instituto de Investigación Biosanitaria Ibs.Granada, Granada, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain., Sánchez-Seco Fariñas MP; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Madrid, Spain.; Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Journal of medical virology [J Med Virol] 2023 Nov; Vol. 95 (11), pp. e29240.
DOI: 10.1002/jmv.29240
Abstrakt: To evaluate molecular assays for Mpox diagnosis available in various clinical microbiology services in Spain through a quality control (QC) approach. A total of 14 centers from across Spain participated in the study. The Reference Laboratory dispatched eight serum samples and eight nucleic acid extracts to each participating center. Some samples were spiked with Mpox or Vaccinia virus to mimic positive samples for Mpox or other orthopox viruses. Participating centers provided information on the results obtained, as well as the laboratory methods used. Among the 14 participating centers seven different commercial assays were employed, with the most commonly used kit being LightMix Modular Orthopox/Monkeypox (Mpox) Virus (Roche®). Of the 12 centers conducting Mpox determinations, concordance ranged from 62.5% (n = 1) to 100% (n = 11) for eluates and from 75.0% (n = 1) to 100% (n = 10) for serum. Among the 10 centers performing Orthopoxvirus determinations, a 100% concordance was observed for eluates, while for serum, concordance ranged from 87.5% (n = 6) to 100% (n = 4). Repeatedly, 6 different centers reported a false negative in serum samples for Orthopoxvirus diagnosis, particularly in a sample with borderline C t  = 39. Conversely, one center, using the TaqMan™ Mpox Virus Microbe Detection Assay (Thermo Fisher), reported false positives in Mpox diagnosis for samples spiked with vaccinia virus due to cross-reactions. We observed a positive correlation of various diagnostic assays for Mpox used by the participating centers with the reference values. Our results highlight the significance of standardization, validation, and ongoing QC in the microbiological diagnosis of infectious diseases, which might be particularly relevant for emerging viruses.
(© 2023 The Authors. Journal of Medical Virology published by Wiley Periodicals LLC.)
Databáze: MEDLINE