Molecular Identification of Enteric Viruses in Domestic Animals in Northeastern Gabon, Central Africa.

Autor: Bohou Kombila L; Unité Émergence des Maladies Virales (UEMV), Département de Virologie, Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon., N'dilimabaka N; Unité Émergence des Maladies Virales (UEMV), Département de Virologie, Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon.; Département de Biologie, Université des Sciences et Techniques de Masuku (USTM), Franceville BP 941, Gabon., Garcia D; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Rieu O; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Engone Ondo JD; Unité des Infections Rétrovirales et Pathologies Associées (UIRPA), Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon., Ndong Mebaley T; Unité Émergence des Maladies Virales (UEMV), Département de Virologie, Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon.; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Boundenga L; Unité de Recherche en Écologie de la Santé (URES), Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon., Fritz M; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Lenguiya LH; Faculté des Sciences et Techniques, Université Marien Ngouabi, Brazzaville BP 69, Congo., Maganga GD; Unité Émergence des Maladies Virales (UEMV), Département de Virologie, Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon.; Institut National Supérieur d'Agronomie et de Biotechnologies (INSAB), Université des Sciences et Techniques de Masuku (USTM), Franceville BP 913, Gabon., Leroy EM; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Becquart P; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France., Mombo IM; Unité Émergence des Maladies Virales (UEMV), Département de Virologie, Centre Interdisciplinaire de Recherches Médicales de Franceville (CIRMF), Franceville BP 769, Gabon.; Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Maladies Infectieuses et Vecteurs, Écologie, Génétique, Évolution et Contrôle (MIVEGEC) (Université de Montpellier-IRD 224-CNRS 5290), 34394 Montpellier, France.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Animals : an open access journal from MDPI [Animals (Basel)] 2023 Aug 03; Vol. 13 (15). Date of Electronic Publication: 2023 Aug 03.
DOI: 10.3390/ani13152512
Abstrakt: Astroviruses (AstVs) , enteroviruses (EVs), and caliciviruses (CaVs) infect several vertebrate taxa. Transmitted through the fecal-oral route, these enteric viruses are highly resistant and can survive in the environment, thereby increasing their zoonotic potential. Here, we screened for AstVs, EVs, and CaVs to investigate the role of domestic animals in the emergence of zoonoses, because they are situated at the human/wildlife interface, particularly in rural forested areas in Central Africa. Rectal swabs were obtained from 123 goats, 41 sheep, and 76 dogs in 10 villages located in northeastern Gabon. Extracted RNA reverse-transcribed into cDNA was used to detect AstVs, EVs, and CaVs by amplification of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), or capsid protein (VP1) gene using PCR. A total of 23 samples tested positive, including 17 goats for AstVs, 2 goats, 2 sheep, 1 dog for EVs, and 1 dog for CaVs. Phylogenetic analyses revealed that AstV RdRp sequences clustered with sheep-, goat-, or bovine-related AstVs. In addition, one goat and two sheep VP1 sequences clustered with caprine/ovine-related Evs within the Enterovirus G species, and the CaV was a canine vesivirus. However, human-pathogenic Evs, EV-B80 and EV-C99, were detected in goats and dogs, raising questions on the maintenance of viruses able to infect humans.
Databáze: MEDLINE
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