SARS-CoV-2 Detection and Culture in Different Biological Specimens from Immunocompetent and Immunosuppressed COVID-19 Patients Infected with Two Different Viral Strains.

Autor:	Mendes-Correa MC; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Hospital das Clínicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, São Paulo 05403-010, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Salomão MC; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Hospital das Clínicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, São Paulo 05403-010, Brazil.; Rua Peixoto Gomide, 645, Sao Paulo 01409-002, Brazil., Ghilardi F; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Tozetto-Mendoza TR; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Santos Villas-Boas L; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., de Paula AV; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Paiao HGO; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., da Costa AC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Leal FE; Faculdade de Medicina da, Universidade Municipal de Sao Caetano do Sul, São Paulo 09521-160, Brazil.; Programa de Oncovirologia, Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro 20230-130, Brazil., Ferraz ABC; Faculdade de Medicina da, Universidade Municipal de Sao Caetano do Sul, São Paulo 09521-160, Brazil., Sales FCS; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Claro IM; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Ferreira NE; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Pereira GM; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., da Silva AR Jr; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Freire W; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Espinoza EPS; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Manuli ER; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil.; Faculdade de Medicina da, Universidade Municipal de Sao Caetano do Sul, São Paulo 09521-160, Brazil., Romano CM; Hospital das Clínicas, Faculdade de Medicina, Universidade de Sao Paulo, São Paulo 05403-010, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., de Jesus JG; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil., Sabino EC; Departamento de Molestias Infecciosas e Parasitarias, Aculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, n. 470, São Paulo 05403-000, Brazil.; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil.; Faculdade de Medicina da, Universidade Municipal de Sao Caetano do Sul, São Paulo 09521-160, Brazil., Witkin SS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo, São Paulo 05403-000, Brazil.; Department of Obstetrics and Gynecology, Weill Cornell Medicine, New York, NY 10065, USA.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Viruses [Viruses] 2023 May 29; Vol. 15 (6). Date of Electronic Publication: 2023 May 29.
DOI:	10.3390/v15061270
Abstrakt:	Introduction-The dynamics of SARS-CoV-2 shedding and replication in humans remain incompletely understood. Methods-We analyzed SARS-CoV-2 shedding from multiple sites in individuals with an acute COVID-19 infection by weekly sampling for five weeks in 98 immunocompetent and 25 immunosuppressed individuals. Samples and culture supernatants were tested via RT-PCR for SARS-CoV-2 to determine viral clearance rates and in vitro replication. Results-A total of 2447 clinical specimens were evaluated, including 557 nasopharyngeal swabs, 527 saliva samples, 464 urine specimens, 437 anal swabs and 462 blood samples. The SARS-CoV-2 genome sequences at each site were classified as belonging to the B.1.128 (ancestral strain) or Gamma lineage. SARS-CoV-2 detection was highest in nasopharyngeal swabs regardless of the virus strain involved or the immune status of infected individuals. The duration of viral shedding varied between clinical specimens and individual patients. Prolonged shedding of potentially infectious virus varied from 10 days up to 191 days, and primarily occurred in immunosuppressed individuals. Virus was isolated in culture from 18 nasal swab or saliva samples collected 10 or more days after onset of disease. Conclusions-Our findings indicate that persistent SARS-CoV-2 shedding may occur in both competent or immunosuppressed individuals, at multiple clinical sites and in a minority of subjects is capable of in vitro replication.
Databáze:	MEDLINE
Externí odkaz:	Zobrazit plný text záznamu Plný text ve formátu PDF Plný text ve formátu HTML
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje	K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.