Genomic Surveillance of SARS-CoV-2 in Healthcare Workers: A Critical Sentinel Group for Monitoring the SARS-CoV-2 Variant Shift.

Autor: Padilha DA; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Souza DSM; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Kawagoe EK; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Filho VB; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Amorim AN; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Barazzetti FH; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Schörner MA; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Fernandes SB; Laboratório Central do Estado da Saúde de Santa Catarina, Florianópolis 88010-001, Santa Catarina, Brazil., Coelho BK; Laboratório Central do Estado da Saúde de Santa Catarina, Florianópolis 88010-001, Santa Catarina, Brazil., Rovaris DB; Laboratório Central do Estado da Saúde de Santa Catarina, Florianópolis 88010-001, Santa Catarina, Brazil., Dos Anjos MPD; Laboratório Central do Estado da Saúde de Santa Catarina, Florianópolis 88010-001, Santa Catarina, Brazil., Moser JR; Diretoria de Vigilância Epidemiológica de Santa Catarina, Florianópolis 88015-130, Santa Catarina, Brazil., Melo FR; Diretoria de Vigilância Epidemiológica de Santa Catarina, Florianópolis 88015-130, Santa Catarina, Brazil., De Souza BB; Diretoria de Vigilância Epidemiológica de Santa Catarina, Florianópolis 88015-130, Santa Catarina, Brazil., Bessa DDC; Diretoria de Vigilância Epidemiológica de Santa Catarina, Florianópolis 88015-130, Santa Catarina, Brazil., Mendes FHPES; Diretoria de Vigilância Epidemiológica de Santa Catarina, Florianópolis 88015-130, Santa Catarina, Brazil., Boing AC; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Boing AF; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Lacerda JT; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Moura GV; Centro de Sócio Econômico, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Bastiani DC; Biome-Hub Pesquisa e Desenvolvimento, Florianópolis 88054-700, Santa Catarina, Brazil., Moraes MH; Biome-Hub Pesquisa e Desenvolvimento, Florianópolis 88054-700, Santa Catarina, Brazil., De Oliveira LFV; Biome-Hub Pesquisa e Desenvolvimento, Florianópolis 88054-700, Santa Catarina, Brazil., Moreira RS; Instituto Federal de Santa Catarina, Gaspar 89111-009, Santa Catarina, Brazil., Stoco PH; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Bazzo ML; Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-370, Santa Catarina, Brazil., Fongaro G; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil., Wagner G; Centro de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Santa Catarina, Florianópolis 88040-900, Santa Catarina, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Viruses [Viruses] 2023 Apr 17; Vol. 15 (4). Date of Electronic Publication: 2023 Apr 17.
DOI: 10.3390/v15040984
Abstrakt: SARS-CoV-2 genome surveillance is important for monitoring risk groups and health workers as well as data on new cases and mortality rate due to COVID-19. We characterized the circulation of SARS-CoV-2 variants from May 2021 to April 2022 in the state of Santa Catarina, southern Brazil, and evaluated the similarity between variants present in the population and healthcare workers (HCW). A total of 5291 sequenced genomes demonstrated the circulation of 55 strains and four variants of concern (Alpha, Delta, Gamma and Omicron-sublineages BA.1 and BA.2). The number of cases was relatively low in May 2021, but the number of deaths was higher with the Gamma variant. There was a significant increase in both numbers between December 2021 and February 2022, peaking in mid-January 2022, when the Omicron variant dominated. After May 2021, two distinct variant groups (Delta and Omicron) were observed, equally distributed among the five Santa Catarina mesoregions. Moreover, from November 2021 to February 2022, similar variant profiles between HCW and the general population were observed, and a quicker shift from Delta to Omicron in HCW than in the general population. This demonstrates the importance of HCW as a sentinel group for monitoring disease trends in the general population.
Databáze: MEDLINE
Externí odkaz:
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje