Exome-First Strategy in Adult Patients With CKD: A Cohort Study.

Autor:	Doreille A; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France., Lombardi Y; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France., Dancer M; Laboratoire Eurofins Biomnis, Lyon, France., Lamri R; Laboratoire Eurofins Biomnis, Lyon, France., Testard Q; Laboratoire Eurofins Biomnis, Lyon, France., Vanhoye X; Laboratoire Eurofins Biomnis, Lyon, France., Lebre AS; Service de génétique, Pole de biologie, Hôpital Maison Blanche, CHU Reims, Reims, France.; Département de Génétique, hôpital Pité Salpétrière, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France., Garcia H; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France., Rafat C; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France., Ouali N; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France., Luque Y; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France., Izzedine H; Department of Nephrology, Peupliers Private Hospital, Ramsay Générale de Santé, Paris, France., Esteve E; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Department of Nephrology, hôpital Tenon, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France., Cez A; Department of Nephrology, hôpital Tenon, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France., Petit-Hoang C; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France., François H; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Inserm UMR_S1155, Paris, France., Marchal A; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Department of Nephrology, hôpital Tenon, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France., Letavernier E; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Department of Nephrology, hôpital Tenon, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Inserm UMR_S1155, Paris, France., Frémeaux-Bacchi V; Immunology Department, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France., Boffa JJ; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Department of Nephrology, hôpital Tenon, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Inserm UMR_S1155, Paris, France., Rondeau E; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Inserm UMR_S1155, Paris, France., Raymond L; Laboratoire Eurofins Biomnis, Lyon, France., Mesnard L; Soins Intensifs Néphrologiques et Rein Aigu, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.; Faculté de médecine, Sorbonne Université, Paris, France.; Inserm UMR_S1155, Paris, France.; Institut des Sciences du Calcul et des Données, Sorbonne Université, Paris, France.; Centre Maladie Rare MAHREA, hôpital Tenon, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Paris, France.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Kidney international reports [Kidney Int Rep] 2022 Dec 17; Vol. 8 (3), pp. 596-605. Date of Electronic Publication: 2022 Dec 17 (Print Publication: 2023).
DOI:	10.1016/j.ekir.2022.12.007
Abstrakt:	Introduction: Exome sequencing (ES) has widened the field of nephrogenomics in adult nephrology. In addition to reporting the diagnostic yield of ES in an adult cohort study, we investigated the clinical implications of molecular diagnosis and developed a clinical score to predict the probability of obtaining positive result. Methods: From September 2018 we have used ES to prospectively perform a first-tier liberal exploration of adult nephropathies of unknown origin and/or when a genetic kidney disease was clinically suggested. We also analyzed copy number variant using the same assay. Results: Molecular diagnosis was made in 127 of 538 patients sequenced (diagnostic yield: 24%), comprising 47 distinct monogenic disorders. Eight of these monogenic disorders (17% [8/47]) accounted for 52% of genetic diagnoses. In 98% ( n  = 125/127) of the patients, the genetic information was reported to have major clinical implications. We developed a 4-value clinical score to predict the probability of obtaining a molecular diagnosis (area under the receiver operating characteristics curve [AUC] 0.726 [95% confidence interval: 0.670-0.782]) (available at http://allogenomics.com/score). Conclusion: This study reinforces the role of ES as a first-tier exploration for adult chronic kidney disease patients in whom phenotypes are often poor and atypical. Although external validation is required, our clinical score could be a useful tool for the implementation of nephrogenomics in adults. (© 2022 Published by Elsevier Inc. on behalf of the International Society of Nephrology.)
Databáze:	MEDLINE
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