PBMCs gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for clinically significant portal hypertension in HIV/HCV coinfected patients: A cross-control study.

Autor:	Salgüero S; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Unidad de Análisis Clínicos, Hospital El Escorial, Spain. Electronic address: sergio.salguero@salud.madrid.org., Brochado-Kith Ó; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: obrochado@isciii.es., Verdices AV; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: virseda.ana@gmail.com., Berenguer J; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Enfermedades Infecciosas/VIH; Hospital General Universitario 'Gregorio Marañón', Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria del Gregorio Marañón, Madrid, Spain. Electronic address: jbb4@me.com., González-García J; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de VIH; Servicio de Medicina Interna, Hospital Universitario 'La Paz', Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria La Paz (IdiPAZ), Madrid, Spain. Electronic address: juangonzalezgar@gmail.com., Martínez I; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: imago@isciii.es., Díez C; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Enfermedades Infecciosas/VIH; Hospital General Universitario 'Gregorio Marañón', Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria del Gregorio Marañón, Madrid, Spain. Electronic address: crispu82@gmail.com., Hontañón V; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de VIH; Servicio de Medicina Interna, Hospital Universitario 'La Paz', Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria La Paz (IdiPAZ), Madrid, Spain. Electronic address: victor.hontanon@gmail.com., Pérez-Latorre L; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Enfermedades Infecciosas/VIH; Hospital General Universitario 'Gregorio Marañón', Madrid, Spain; Instituto de Investigación Sanitaria del Gregorio Marañón, Madrid, Spain. Electronic address: legor78@hotmail.com., Fernández-Rodríguez A; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: amandafr@isciii.es., Jiménez-Sousa MÁ; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: jimenezsousa@isciii.es., Resino S; Unidad de Infección Viral e Inmunidad, Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Madrid, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: sresino@isciii.es.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie [Biomed Pharmacother] 2023 Mar; Vol. 159, pp. 114220. Date of Electronic Publication: 2023 Jan 09.
DOI:	10.1016/j.biopha.2023.114220
Abstrakt:	Background: Patients with advanced cirrhosis are at high risk of developing clinically significant portal hypertension (CSPH). We analyzed the gene expression profile of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from HIV/HCV coinfected patients to identify a gene expression signature of advanced cirrhosis with high risk for CSPH. Methods: We conducted a cross-sectional study on 68 patients. Liver stiffness measurement (LSM) was used to stratify patients into < 12.5 kPa (no cirrhosis, n = 19), 12.5 - 24.9 kPa (cirrhosis, n = 20), and ≥ 25 kPa (advanced cirrhosis with high risk for CSPH, n = 29). Besides, we further evaluated LSM < 25 kPa (n = 39) vs. ≥ 25 kPa (n = 29). Total RNA was extracted from PBMCs, and poly(A) RNA sequencing was performed. Two significant differentially expressed (SDE) transcripts were validated by quantitative PCR in a different cohort (n = 46). Results: We found 60 SDE transcripts between patients with LSM < 12.5 kPa and ≥ 25 kPa. Partial least squares discriminant analysis showed that those 60 SDE transcripts collectively discriminated LSM ≥ 25 kPa, with an area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) of 0.84. Eight genes had an AUROC ≥ 0.75 for LSM ≥ 25 kPa: five were positively associated with LSM values (SCAMP1, ABHD17B, GPR146, GTF2A1, and TMEM64), while three were inversely associated (ZFHX2-AS1, MDK, and STAG3L2). We validated the two SDE transcripts with the highest discrimination capacity in a different cohort, finding significant differences between < 25 kPa and ≥ 25 kPa (MDK (p = 0.006) and STAG3L2 (p = 0.021)). Conclusions: A gene expression signature of 60 transcripts was associated with advanced cirrhosis with high risk for CSPH in HIV/HCV coinfected patients. Competing Interests: Competing interests The authors declare that they have no competing interests. (Copyright © 2023 The Authors. Published by Elsevier Masson SAS.. All rights reserved.)
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