| Autor: |
Santos-Neto JF; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Santos ACM; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Nascimento JAS; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Trovão LO; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Santos FF; Laboratório Alerta, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04039-032, Brazil., Valiatti TB; Laboratório Alerta, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04039-032, Brazil., Gales AC; Laboratório Alerta, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04039-032, Brazil., Marques ALVR; Irmandade da Santa Casa de Misericórdia de Mogi Guaçu, Mogi Guaçu 13840-005, Brazil., Pinaffi IC; Laboratório Santa Cruz Medicina Diagnóstica, Mogi Guaçu 13840-052, Brazil., Vieira MAM; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Silva RM; Laboratório de Enterobacterias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil., Falsetti IN; Irmandade da Santa Casa de Misericórdia de Mogi Guaçu, Mogi Guaçu 13840-005, Brazil.; Laboratório Santa Cruz Medicina Diagnóstica, Mogi Guaçu 13840-052, Brazil., Gomes TAT; Laboratório Experimental de Patogenicidade de Enterobactérias, Disciplina de Microbiologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, São Paulo 04023-062, Brazil. |
| Abstrakt: |
Extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) may inhabit the human gut microbiota without causing disease. However, if they reach extra-intestinal sites, common cystitis to bloodstream infections may occur, putting patients at risk. To examine the human gut as a source of endogenous infections, we evaluated the E. coli clonal diversity of 18 inpatients' guts and their relationship with strains isolated from urinary tract infection (UTI) in the same hospital. Random amplified polymorphic DNA evaluated the clonal diversity, and the antimicrobial susceptibility was determined by disk diffusion. One isolate of each clone detected was sequenced, and their virulome and resistome were determined. Overall, 177 isolates were screened, among which 32 clones were identified (mean of two clones per patient), with ExPEC strains found in over 75% of the inpatients' guts. Endogenous infection was confirmed in 75% of the cases. ST10, ST59, ST69, ST131, and ST1193 clones and critical mobile drug-resistance encoding genes ( bla CTX-M-15 , bla OXA-1 , bla DHA-1 , aac(6')-lb-cr, mcr-1.26, qnrB4 , and qnrB19 ) were identified in the gut of inpatients. The genomic analysis highlighted the diversity of the fecal strains, colonization by lactose-negative E. coli , the high frequency of ExPEC in the gut of inpatients without infections, and the presence of β-lactamase producing E. coli in the gut of inpatients regardless of the previous antibiotics' usage. Considering that we found more than one ExPEC clone in the gut of several inpatients, surveillance of inpatients' fecal pathogens may prevent UTI caused by E. coli in the hospital and dissemination of risk clones. |
