Connecting multiple microenvironment proteomes uncovers the biology in head and neck cancer.

Autor: Busso-Lopes AF; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Neves LX; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Câmara GA; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Granato DC; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Pretti MAM; Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA, Rio de Janeiro, RJ, 20231-050, Brazil., Heberle H; Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo - USP, São Carlos, SP, 13566-590, Brazil., Patroni FMS; Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética - CBMEG, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil., Sá J; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Yokoo S; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Rivera C; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.; Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil.; Departamento de Ciencias Básicas Biomédicas, Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad de Talca - UTALCA, Talca, Maule, Chile., Domingues RR; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Normando AGC; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil.; Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil., De Rossi T; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Mello BP; Departamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-903, Brazil., Galdino NAL; Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil., Pauletti BA; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil., Lacerda PA; Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil., Rodrigues AAN; Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil., Casarim ALM; Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil., de Lima-Souza RA; Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil., Damas II; Departamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil., Mariano FV; Departamento de Patologia, Faculdade de Ciências Médicas, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Campinas, SP, 13083-887, Brazil., Gollob KJ; Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil.; Hospital Israelita Albert Einstein, São Paulo, SP, 05652- 900, Brazil., Medina TS; Centro Internacional de Pesquisa - CIPE, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01508-010, Brazil., Cervigne NK; Departamento de Clínica Médica, Faculdade de Medicina de Jundiaí - FMJ, Jundiaí, SP, 13202-550, Brazil., Prado-Ribeiro AC; Departamento de Diagnóstico Oral, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Universidade Estadual de Campinas - UNICAMP, Piracicaba, SP, 13414-903, Brazil.; Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil., Brandão TB; Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil., Villa LL; Departamento de Radiologia e Oncologia, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-903, Brazil.; Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil., Uno M; Instituto do Câncer do Estado de São Paulo - ICESP, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-000, Brazil., Boroni M; Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, Divisão de Pesquisa Experimental e Translacional, Instituto Nacional do Câncer - INCA, Rio de Janeiro, RJ, 20231-050, Brazil., Kowalski LP; Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço e Otorrinolaringologia, A.C. Camargo Cancer Center, São Paulo, SP, 01509-900, Brazil.; Departamento de Cirurgia de Cabeça e Pescoço, Faculdade de Medicina, Universidade de São Paulo - USP, São Paulo, SP, 01246-903, Brazil., González-Arriagada WA; Facultad de Odontología, Patología Oral y Maxilofacial, Universidad de Los Andes, Santiago, Chile.; Centro de Investigación e Innovación Biomédica, Universidad de Los Andes, Santiago, Chile., Paes Leme AF; Laboratório Nacional de Biociências - LNBio, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, Campinas, SP, 13083-100, Brazil. adriana.paesleme@lnbio.cnpem.br.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Nature communications [Nat Commun] 2022 Nov 07; Vol. 13 (1), pp. 6725. Date of Electronic Publication: 2022 Nov 07.
DOI: 10.1038/s41467-022-34407-1
Abstrakt: The poor prognosis of head and neck cancer (HNC) is associated with metastasis within the lymph nodes (LNs). Herein, the proteome of 140 multisite samples from a 59-HNC patient cohort, including primary and matched LN-negative or -positive tissues, saliva, and blood cells, reveals insights into the biology and potential metastasis biomarkers that may assist in clinical decision-making. Protein profiles are strictly associated with immune modulation across datasets, and this provides the basis for investigating immune markers associated with metastasis. The proteome of LN metastatic cells recapitulates the proteome of the primary tumor sites. Conversely, the LN microenvironment proteome highlights the candidate prognostic markers. By integrating prioritized peptide, protein, and transcript levels with machine learning models, we identify nodal metastasis signatures in blood and saliva. We present a proteomic characterization wiring multiple sites in HNC, thus providing a promising basis for understanding tumoral biology and identifying metastasis-associated signatures.
(© 2022. The Author(s).)
Databáze: MEDLINE
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