Discovery of two novel Torque Teno viruses in Callithrix penicillata provides insights on Anelloviridae diversification dynamics.

Autor: Cosentino MAC; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., D'arc M; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Moreira FRR; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.; Department of Infectious Diseases Epidemiology, Imperial College London, London, United Kingdom., Cavalcante LTF; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Mouta R; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Coimbra A; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Schiffler FB; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Miranda TDS; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Medeiros G; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Dias CA; Centro de Primatologia, Universidade de Brasília, Brasília, Brazil., Souza AR; Centro de Primatologia, Universidade de Brasília, Brasília, Brazil., Tavares MCH; Centro de Primatologia, Universidade de Brasília, Brasília, Brazil., Tanuri A; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Soares MA; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.; Programa de Oncovirologia, Instituto Nacional de Câncer, Rio de Janeiro, Brazil., Dos Santos AFA; Laboratório de Diversidade e Doenças Virais, Departamento de Genética, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Frontiers in microbiology [Front Microbiol] 2022 Sep 08; Vol. 13, pp. 1002963. Date of Electronic Publication: 2022 Sep 08 (Print Publication: 2022).
DOI: 10.3389/fmicb.2022.1002963
Abstrakt: The development of high-throughput sequencing (HTS) technologies and metagenomics protocols deeply impacted the discovery of viral diversity. Moreover, the characterization of novel viruses in the Neotropical primates (NP) is central for the comprehension of viral evolution dynamics in those hosts, due to their evolutionary proximity to Old World primates, including humans. In the present work, novel anelloviruses were detected and characterized through HTS protocols in the NP Callithrix penicillata , the common black-tufted marmoset. De novo assembly of generated sequences was carried out, and a total of 15 contigs were identified with complete Anelloviridae ORF1 gene, two of them including a flanking GC-rich region, confirming the presence of two whole novel genomes of ~3 kb. The identified viruses were monophyletic within the Epsilontorquevirus genus, a lineage harboring previously reported anelloviruses infecting hosts from the Cebidae family. The genetic divergence found in the new viruses characterized two novel species, named Epsilontorquevirus callithrichensis I and II . The phylogenetic pattern inferred for the Epsilontorquevirus genus was consistent with the topology of their host species tree, echoing a virus-host diversification model observed in other viral groups. This study expands the host span of Anelloviridae and provides insights into their diversification dynamics, highlighting the importance of sampling animal viral genomes to obtain a clearer depiction of their long-term evolutionary processes.
Competing Interests: The authors declare that the research was conducted in the absence of any commercial or financial relationships that could be construed as a potential conflict of interest.
(Copyright © 2022 Cosentino, D’arc, Moreira, Cavalcante, Mouta, Coimbra, Schiffler, Miranda, Medeiros, Dias, Souza, Tavares, Tanuri, Soares and Santos.)
Databáze: MEDLINE