Shotgun metagenomic sequencing of the first case of monkeypox virus in Brazil, 2022.

Autor: Claro IM; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom., Romano CM; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., Candido DDS; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.; University of Oxford, Department of Zoology, Oxford, United Kingdom., Lima EL; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Lindoso JAL; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil.; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, São Paulo, São Paulo, Brazil., Ramundo MS; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., Moreira FRR; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.; Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Biologia, Departamento de Genética, Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil., Barra LAC; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Borges LMS; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Medeiros LA; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Tomishige MYS; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Moutinho T; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, São Paulo, São Paulo, Brazil., Silva AJDD; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Rodrigues CCM; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Azevedo LCF; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Villas-Boas LS; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., Silva CAMD; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., Coletti TM; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., Manuli ER; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil., O'Toole A; University of Edinburgh, Institute of Ecology and Evolution, Edinburgh, United Kingdom., Quick J; University of Birmingham, School of Biosciences, Birmingham, United Kingdom., Loman N; University of Birmingham, School of Biosciences, Birmingham, United Kingdom., Rambaut A; University of Edinburgh, Institute of Ecology and Evolution, Edinburgh, United Kingdom., Faria NR; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.; Imperial College London, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, London, United Kingdom.; University of Oxford, Department of Zoology, Oxford, United Kingdom., Figueiredo-Mello C; Instituto de Infectologia Emílio Ribas, São Paulo, São Paulo, Brazil., Sabino EC; Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, São Paulo, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Revista do Instituto de Medicina Tropical de Sao Paulo [Rev Inst Med Trop Sao Paulo] 2022 Jun 24; Vol. 64, pp. e48. Date of Electronic Publication: 2022 Jun 24 (Print Publication: 2022).
DOI: 10.1590/S1678-9946202264048
Abstrakt: Monkeypox virus (MPXV), a zoonotic virus endemic to the African continent, has been reported in 33 non-endemic countries since May 2022. We report an almost complete genome of the first confirmed case of MPXV in Brazil. Shotgun metagenomic sequencing was completed in 18 hours, from DNA extraction to consensus sequence generation.
Databáze: MEDLINE