| Autor: |
Lima JRS; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil., Azevedo-Pinheiro J; Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM), Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, PA, Brazil., Andrade RB; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil.; Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM), Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, PA, Brazil., Khayat AS; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil., Assumpção PP; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil., Ribeiro-Dos-Santos Â; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil.; Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM), Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, PA, Brazil., Batista Dos Santos SE; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil.; Laboratório de Genética Humana e Médica (LGHM), Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular, Universidade Federal do Pará, Belém 66075-110, PA, Brazil., Moreira FC; Núcleo de Pesquisas em Oncologia (NPO), Programa de Pós-Graduação em Oncologia e Ciências Médicas, Universidade Federal do Pará, Belém 66073-005, PA, Brazil. |
| Abstrakt: |
piRNAs are a class of noncoding RNAs that perform functions in epigenetic regulation and silencing of transposable elements, a mechanism conserved among most mammals. At present, there are more than 30,000 known piRNAs in humans, of which more than 80% are derived from intergenic regions, and approximately 20% are derived from the introns and exons of pre-mRNAs. It was observed that the expression of the piRNA profile is specific in several organs, suggesting that they play functional roles in different tissues. In addition, some studies suggest that changes in regions that encode piRNAs may have an impact on their function. To evaluate the conservation of these regions and explore the existence of a seed region, SNP and INDEL variant rates were investigated in several genomic regions and compared to piRNA region variant rates. Thus, data analysis, data collection, cleaning, treatment, and exploration were implemented using the R programming language with the help of the RStudio platform. We found that piRNA regions are highly conserved after considering INDELs and do not seem to present an identifiable seed region after considering SNPs and INDEL variants. These findings may contribute to future studies attempting to determine how polymorphisms in piRNA regions can impact diseases. |
