SM-COLSARSPROT: Highly Immunogenic Supramutational Synthetic Peptides Covering the World's Population.

Autor: Patarroyo MA; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Patarroyo ME; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Pabón L; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Alba MP; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Bermudez A; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Rugeles MT; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia., Díaz-Arevalo D; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Zapata-Builes W; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia., Zapata MI; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia., Reyes C; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Suarez CF; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Agudelo W; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., López C; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Aza-Conde J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Melo M; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Escamilla L; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Oviedo J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Guzmán F; Núcleo de Biotecnología, Pontificia U. Católica de Valparaíso, Valparaíso, Chile., Silva Y; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Forero M; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Flórez-Álvarez L; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia., Aguilar-Jimenez W; Grupo Inmunovirología, Facultad de Medicina, Universidad de Antioquia UdeA, Medellín, Colombia., Moreno-Vranich A; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Garry J; Grupos: Síntesis Química, Resonancia Magnética Nuclear y Cálculo Estructural, Biología Molecular e Inmunología e Inmuno-Química, Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC), Bogotá, Colombia., Avendaño C; Facultad de Ciencias Agropecualrias, Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (UDCA), Bogotá, Colombia.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Frontiers in immunology [Front Immunol] 2022 May 25; Vol. 13, pp. 859905. Date of Electronic Publication: 2022 May 25 (Print Publication: 2022).
DOI: 10.3389/fimmu.2022.859905
Abstrakt: Fifty ~20-amino acid (aa)-long peptides were selected from functionally relevant SARS-CoV-2 S, M, and E proteins for trial B-21 and another 53 common ones, plus some new ones derived from the virus' main genetic variants for complementary trial C-21 . Peptide selection was based on tremendous SARS-CoV-2 genetic variability for analysing them concerning vast human immunogenetic polymorphism for developing the first supramutational, Colombian SARS-protection (SM-COLSARSPROT), peptide mixture. Specific physicochemical rules were followed, i.e., aa predilection for polyproline type II left-handed (PPII L ) formation, replacing β-branched, aromatic aa, short-chain backbone H-bond-forming residues, π-π interactions (n→π* and π-CH), aa interaction with π systems, and molecular fragments able to interact with them, disrupting PPII L propensity formation. All these modified structures had PPII L formation propensity to enable target peptide interaction with human leukocyte antigen-DRβ1* (HLA-DRβ1*) molecules to mediate antigen presentation and induce an appropriate immune response. Such modified peptides were designed for human use; however, they induced high antibody titres against S, M, and E parental mutant peptides and neutralising antibodies when suitably modified and chemically synthesised for immunising 61 major histocompatibility complex class II (MHCII) DNA genotyped Aotus monkeys (matched with their corresponding HLA-DRβ1* molecules), predicted to cover 77.5% to 83.1% of the world's population. Such chemically synthesised peptide mixture represents an extremely pure, stable, reliable, and cheap vaccine for COVID-19 pandemic control, providing a new approach for a logical, rational, and soundly established methodology for other vaccine development.
Competing Interests: The authors declare that this study received funding from Greenstone International Foundation Limited. The funder was not involved in the study design and/or the collection, analysis and /or interpretation of data, the writing of the article or the decision to submit it for publication.
(Copyright © 2022 Patarroyo, Patarroyo, Pabón, Alba, Bermudez, Rugeles, Díaz-Arevalo, Zapata-Builes, Zapata, Reyes, Suarez, Agudelo, López, Aza-Conde, Melo, Escamilla, Oviedo, Guzmán, Silva, Forero, Flórez-Álvarez, Aguilar-Jimenez, Moreno-Vranich, Garry and Avendaño.)
Databáze: MEDLINE
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