The Mitogenome Relationships and Phylogeography of Barn Swallows (Hirundo rustica).

Autor:	Lombardo G; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Rambaldi Migliore N; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Colombo G; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Capodiferro MR; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Formenti G; Vertebrate Genome Laboratory, The Rockefeller University, New York, NY 10065, USA., Caprioli M; Dipartimento di Scienze e Politiche Ambientali, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Moroni E; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Caporali L; IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna, Programma di Neurogenetica, 40139 Bologna, Italy., Lancioni H; Dipartimento di Chimica, Biologia e Biotecnologie, Università di Perugia, 06123 Perugia, Italy., Secomandi S; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Gallo GR; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Costanzo A; Dipartimento di Scienze e Politiche Ambientali, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Romano A; Dipartimento di Scienze e Politiche Ambientali, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Garofalo M; Genomic and Post-Genomic Unit, IRCCS Mondino Foundation, 27100 Pavia, Italy., Cereda C; Genomic and Post-Genomic Unit, IRCCS Mondino Foundation, 27100 Pavia, Italy., Carelli V; IRCCS Istituto delle Scienze Neurologiche di Bologna, Programma di Neurogenetica, 40139 Bologna, Italy.; Dipartimento di Scienze Biomediche e Neuromotorie, Università di Bologna, 40139 Bologna, Italy., Gillespie L; Department of Academic Education, Central Community College, Columbus, NE 68601, USA., Liu Y; State Key Laboratory of Biocontrol, School of Ecology, Sun Yat-sen University, Guangzhou 510275, China., Kiat Y; Israeli Bird Ringing Center (IBRC), Israel Ornithological Center, Tel Aviv, Israel., Marzal A; Department of Zoology, University of Extremadura, 06071 Badajoz, Spain., López-Calderón C; Department of Wetland Ecology, Estación Biológica de Doñana CSIC, 41092 Seville, Spain., Balbontín J; Department of Zoology, University of Seville, 41012 Seville, Spain., Mousseau TA; Department of Biological Sciences, University of South Carolina, Columbia, SC 29208, USA., Matyjasiak P; Institute of Biological Sciences, Cardinal Stefan Wyszyński University in Warsaw, 01-938 Warsaw, Poland., Møller AP; Ecologie Systématique Evolution, Université Paris-Sud, CNRS, AgroParisTech, Université Paris-Saclay, 91405, Orsay Cedex, France., Semino O; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Ambrosini R; Dipartimento di Scienze e Politiche Ambientali, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Bonisoli-Alquati A; Department of Biological Sciences, California State Polytechnic University - Pomona, Pomona, CA 91767, USA., Rubolini D; Dipartimento di Scienze e Politiche Ambientali, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Ferretti L; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Achilli A; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Gianfranceschi L; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, 20133 Milan, Italy., Olivieri A; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy., Torroni A; Dipartimento di Biologia e Biotecnologie 'Lazzaro Spallanzani', Università di Pavia, 27100 Pavia, Italy.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Molecular biology and evolution [Mol Biol Evol] 2022 Jun 02; Vol. 39 (6).
DOI:	10.1093/molbev/msac113
Abstrakt:	The barn swallow (Hirundo rustica) poses a number of fascinating scientific questions, including the taxonomic status of postulated subspecies. Here, we obtained and assessed the sequence variation of 411 complete mitogenomes, mainly from the European H. r. rustica, but other subspecies as well. In almost every case, we observed subspecies-specific haplogroups, which we employed together with estimated radiation times to postulate a model for the geographical and temporal worldwide spread of the species. The female barn swallow carrying the Hirundo rustica ancestral mitogenome left Africa (or its vicinity) around 280 thousand years ago (kya), and her descendants expanded first into Eurasia and then, at least 51 kya, into the Americas, from where a relatively recent (<20 kya) back migration to Asia took place. The exception to the haplogroup subspecies specificity is represented by the sedentary Levantine H. r. transitiva that extensively shares haplogroup A with the migratory European H. r. rustica and, to a lesser extent, haplogroup B with the Egyptian H. r. savignii. Our data indicate that rustica and transitiva most likely derive from a sedentary Levantine population source that split at the end of the Younger Dryas (YD) (11.7 kya). Since then, however, transitiva received genetic inputs from and admixed with both the closely related rustica and the adjacent savignii. Demographic analyses confirm this species' strong link with climate fluctuations and human activities making it an excellent indicator for monitoring and assessing the impact of current global changes on wildlife. (© The Author(s) 2022. Published by Oxford University Press on behalf of Society for Molecular Biology and Evolution.)
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