A Nonsense Variant in CCDC65 Gene Causes Respiratory Failure Associated with Increased Lamb Mortality in French Lacaune Dairy Sheep.

Autor:	Ben Braiek M; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Moreno-Romieux C; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Allain C; UE Domaine de La Fage, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et L'environnement (INRAE), 12250 Saint-Jean et Saint-Paul, France., Bardou P; Sigenae, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et L'environnement (INRAE), 31326 Castanet-Tolosan, France., Bordes A; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Debat F; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Drögemüller C; Institute of Genetics, Vetsuisse Faculty, University of Bern, 3012 Bern, Switzerland., Plisson-Petit F; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Portes D; UE Domaine de La Fage, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et L'environnement (INRAE), 12250 Saint-Jean et Saint-Paul, France., Sarry J; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Tadi N; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Woloszyn F; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France., Fabre S; GenPhySE, Université de Toulouse, Institut National de Recherche Pour L'agriculture, L'alimentation et l'environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), 31326 Castanet-Tolosan, France.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Genes [Genes (Basel)] 2021 Dec 24; Vol. 13 (1). Date of Electronic Publication: 2021 Dec 24.
DOI:	10.3390/genes13010045
Abstrakt:	We recently demonstrated that the Lacaune deficient homozygous haplotype 6 (LDHH6) potentially hosts a recessive perinatal lethal mutation in Lacaune dairy sheep mapped on OAR3. In the present study, we have analyzed the whole-genome sequences of two Lacaune ram heterozygous carriers of LDHH6. After variant calling and filtering against the variants of 86 non-carrier rams, we have identified a single nucleotide variant (SNV) in the two LDHH6 carriers whose variant allele induced a premature stop codon (p.Glu111*) in the Coiled-Coil Domain Containing 65 ( CCDC65 ) gene. CCDC65 is involved in the assembly of the nexin-dynein regulatory complex for the formation of microtubules in ciliated cells. In order to identify the phenotype in homozygous sheep, we generated at-risk matings ( n = 17) between rams and ewes heterozygous for the candidate variant in CCDC65 . A total of 16 lambs were born alive with five genotyped as homozygous carriers. The homozygous lambs suffered from respiratory problems, and four of them died within the first month of life. At necropsy, we observed a broad hepatization of lung lobes possibly induced by infectious pneumonia. The management of this lethal recessive allele (frequency of 0.06) through reasoned mating in the Lacaune sheep selection schemes could reduce lamb mortality by 2%.
Databáze:	MEDLINE
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