Large-scale topological disruption of chromosome territories 9 and 22 is associated with nonresponse to treatment in CML.

Autor:	Fabian-Morales E; Doctorado en Ciencias Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., Vallejo-Escamilla D; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., Gudiño A; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico., Rodríguez A; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico.; Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., González-Barrios R; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., Rodríguez Torres YL; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico., Castro Hernández C; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., de la Torre-Luján AH; Departamento de Hematología, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico., Oliva-Rico DA; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., Ornelas Guzmán EC; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico., López Saavedra A; Unidad de Aplicaciones Avanzadas en Microscopía (ADMiRA), Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Red de Apoyo a la Investigación (RAI), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico., Frias S; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico.; Laboratorio de Citogenética, Instituto Nacional de Pediatría (INP), Mexico City, Mexico., Herrera LA; Unidad de Investigación Biomédica en Cáncer, Instituto Nacional de Cancerología (INCan), Mexico City, Mexico.; Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, Apartado Postal 70228, Mexico City, Mexico.; Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Mexico City, Mexico.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	International journal of cancer [Int J Cancer] 2022 May 01; Vol. 150 (9), pp. 1455-1470. Date of Electronic Publication: 2021 Dec 29.
DOI:	10.1002/ijc.33903
Abstrakt:	Chronic myeloid leukemia (CML) is a myeloproliferative neoplasm defined by the presence of t(9;22) translocation whose origin has been associated with the tridimensional genome organization. This rearrangement leads to the fusion of BCR and ABL1 genes giving rise to a chimeric protein with constitutive kinase activity. Imatinib, a tyrosine kinase inhibitor (TKI), is used as a first-line treatment for CML, though ~40% of CML patients do not respond. Here, using structured illumination microscopy (SIM) and 3D reconstruction, we studied the 3D organization patterns of the ABL1 and BCR genes, and their chromosome territories (CTs) CT9 and CT22, in CD34+ cells from CML patients that responded or not to TKI. We found that TKI resistance in CML is associated with high levels of structural disruption of CT9 and CT22 in CD34+ cells, increased CT volumes (especially for CT22), intermingling between CT9 and CT22, and an open-chromatin epigenetic mark in CT22. Altogether our results suggest that large-scale disruption of CT9 and CT22 correlates with the clinical response of CML patients, which could be translated into a potential prognostic marker of response to treatment in this disease and provide novel insights into the mechanisms underlying resistance to TKI in CML. (© 2021 The Authors. International Journal of Cancer published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of UICC.)
Databáze:	MEDLINE
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