Association Analysis Between the Functional Single Nucleotide Variants in miR-146a, miR-196a-2, miR-499a, and miR-612 With Acute Lymphoblastic Leukemia.

Autor:	Jiménez-Morales S; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Núñez-Enríquez JC; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Cruz-Islas J; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Bekker-Méndez VC; Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología 'Dr. Daniel Méndez Hernández', 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Jiménez-Hernández E; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General 'Gaudencio González Garza', Centro Médico Nacional 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Medina-Sanson A; Departamento de Hemato-Oncología, Hospital Infantil de México Federico Gómez, Mexico City, Mexico., Olarte-Carrillo I; Servicio de Hematología, Departamento de Investigación, Hospital General de México Dr. Eduardo Liceaga, Mexico City, Mexico., Martínez-Tovar A; Servicio de Hematología, Departamento de Investigación, Hospital General de México Dr. Eduardo Liceaga, Mexico City, Mexico., Flores-Lujano J; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Ramírez-Bello J; Departamento de Endocrinología, Instituto Nacional de Cardiología, Ignacio Chávez, México City, Mexico., Pérez-Saldívar ML; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Martín-Trejo JA; Servicio de Hematología Pediátrica Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', IMSS, Mexico City, Mexico., Pérez-Lorenzana H; Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital General 'Gaudencio González Garza', Centro Médico Nacional (CMN) 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Amador-Sánchez R; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General Regional 'Carlos McGregor Sánchez Navarro', IMSS, Mexico City, Mexico., Mora-Ríos FG; Cirugía Pediátrica, Hospital Regional 'General Ignacio Zaragoza', Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Mexico City, Mexico., Peñaloza-González JG; Servicio de Onco-Pediatria, Hospital Juárez de México, Mexico City, Mexico., Duarte-Rodríguez DA; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Torres-Nava JR; Servicio de Oncología, Hospital Pediátrico de Moctezuma, Secretaría de Salud de la Ciudad de México (SSCDMX), Mexico City, Mexico., Flores-Bautista JE; Servicio de Pediatría, Hospital General de Tláhuac, Mexico City, Mexico., Espinosa-Elizondo RM; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General de México, Mexico City, Mexico., Román-Zepeda PF; Coordinación Clínica y Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital General Regional (HGR) No. 1 'Dr. Carlos Mac Gregor Sánchez Navarro', IMSS, Mexico City, Mexico., Flores-Villegas LV; Servicio de Hematología Pediátrica, Centro Médico Nacional '20 de Noviembre', ISSSTE, Mexico City, Mexico., Tamez-Gómez EL; Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico., López-García VH; Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico., Lara-Ramos JR; Servicio de Hemato-Oncología Hospital Infantil de Tamaulipas, Cd. Victoria, Mexico., González-Ulivarri JE; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztacalco, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Martínez-Silva SI; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztapalapa, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Espinoza-Anrubio G; Servicio de Pediatría, Hospital General Zona (HGZ) No. 8 'Dr. Gilberto Flores Izquierdo' IMSS, Mexico City, Mexico., Almeida-Hernández C; Jefatura de Enseñanza, Hospital General de Ecatepec 'Las Américas', Instituto de Salud del Estado de México (ISEM), Mexico City, Mexico., Ramírez-Colorado R; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico La Villa, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Hernández-Mora L; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico San Juan de Aragón, Secretaría de Salud (SS), Mexico City, Mexico., García-López LR; Servicio de Pediatría, Hospital Pediátrico de Tacubaya, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Cruz-Ojeda GA; Coordinación Clínica de Educación e Investigación en Salud, HGZ No. 47, IMSS, Mexico City, Mexico., Godoy-Esquivel AE; Servicio de Cirugía Pediátrica, Hospital Pediátrico de Moctezuma, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Contreras-Hernández I; Coordinación de Investigación en Salud, IMSS, Mexico City, Mexico., Medina-Hernández A; Pediatría, Hospital Materno-Pediátrico de Xochimilco, SSCDMX, Mexico City, Mexico., López-Caballero MG; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Coyoacán, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Hernández-Pineda NA; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 76, IMSS, Mexico City, Mexico., Granados-Kraulles J; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 76, IMSS, Mexico City, Mexico., Rodríguez-Vázquez MA; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 68, IMSS, Mexico City, Mexico., Torres-Valle D; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 71, IMSS, Mexico City, Mexico., Cortés-Reyes C; Pediatría, Hospital General Dr. Darío Fernández Fierro, ISSSTE, Mexico City, Mexico., Medrano-López F; Coordinación Clínica y Servicio de Pediatría, HGR No. 72 'Dr. Vicente Santos Guajardo', IMSS, Mexico City, Mexico., Pérez-Gómez JA; Coordinación Clínica y Servicio de Pediatría, HGR No. 72 'Dr. Vicente Santos Guajardo', IMSS, Mexico City, Mexico., Martínez-Ríos A; Cirugía Pediátrica del Hospital Regional 'General Ignacio Zaragoza', ISSSTE, Mexico City, Mexico., Aguilar-De-Los-Santos A; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 98, IMSS, Mexico City, Mexico., Serafin-Díaz B; Coordinación Clínica y Pediatría del Hospital General de Zona 57, IMSS, Mexico City, Mexico., Gutiérrez-Rivera ML; Servicio de Oncología Pediátrica Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', IMSS, Mexico City, Mexico., Merino-Pasaye LE; Jefatura de Enseñanza, Hospital Pediátrico de Iztapalapa, SSCDMX, Mexico City, Mexico., Vargas-Alarcón G; Departamento of Biología Molecular, Instituto Nacional de Cardiología Ignacio Chávez, Mexico City, Mexico., Mata-Rocha M; Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', IMSS, Mexico City, Mexico., Sepúlveda-Robles OA; Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', IMSS, Mexico City, Mexico., Rosas-Vargas H; Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', IMSS, Mexico City, Mexico., Hidalgo-Miranda A; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Mejía-Aranguré JM; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico.; Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, Unidad Medica de Alta Especialidad (UMAE) Hospital de Pediatría 'Dr. Silvestre Frenk Freund', Centro Médico Nacional 'Siglo XXI', IMSS, Mexico City, Mexico.; Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Frontiers in oncology [Front Oncol] 2021 Nov 05; Vol. 11, pp. 762063. Date of Electronic Publication: 2021 Nov 05 (Print Publication: 2021).
DOI:	10.3389/fonc.2021.762063
Abstrakt:	Background: Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is characterized by an abnormal proliferation of immature lymphocytes, in whose development involves both environmental and genetic factors. It is well known that single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding and noncoding genes contribute to the susceptibility to ALL. This study aims to determine whether SNPs in miR-146a , miR-196a-2 , miR-499a , and miR-612 genes are associated with the risk to ALL in pediatric Mexican population. Methods: A multicenter case-control study was carried out including patients with de novo diagnosis of ALL and healthy subjects as control group. The DNA samples were obtained from saliva and peripheral blood, and the genotyping of rs2910164, rs12803915, rs11614913, and rs3746444 was performed using the 5'exonuclease technique. Gene-gene interaction was evaluated by the multifactor dimensionality reduction (MDR) software. Results: miR-499a rs3746444 showed significant differences among cases and controls. The rs3746444G allele was found as a risk factor to ALL (OR, 1.6 [95% CI, 1.05-2.5]; p = 0.028). The homozygous GG genotype of rs3746444 confers higher risk to ALL than the AA genotype (OR, 5.3 [95% CI, 1.23-23.4]; p = 0.01). Moreover, GG genotype highly increases the risk to ALL in male group (OR, 17.6 [95% CI, 1.04-298.9]; p = 0.00393). In addition, an association in a gender-dependent manner among SNPs located in miR-146a and miR-196a-2 genes and ALL susceptibility was found. Conclusion: Our findings suggest that SNP located in miR-499a , miR-146a , and miR-196a-2 genes confer risk to ALL in Mexican children. Experimental analysis to decipher the role of these SNPs in human hematopoiesis could improve our understanding of the molecular mechanism underlying the development of ALL. Competing Interests: The authors declare that the research was conducted in the absence of any commercial or financial relationships that could be construed as a potential conflict of interest. (Copyright © 2021 Jiménez-Morales, Núñez-Enríquez, Cruz-Islas, Bekker-Méndez, Jiménez-Hernández, Medina-Sanson, Olarte-Carrillo, Martínez-Tovar, Flores-Lujano, Ramírez-Bello, Pérez-Saldívar, Martín-Trejo, Pérez-Lorenzana, Amador-Sánchez, Mora-Ríos, Peñaloza-González, Duarte-Rodríguez, Torres-Nava, Flores-Bautista, Espinosa-Elizondo, Román-Zepeda, Flores-Villegas, Tamez-Gómez, López-García, Lara-Ramos, González-Ulivarri, Martínez-Silva, Espinoza-Anrubio, Almeida-Hernández, Ramírez-Colorado, Hernández-Mora, García-López, Cruz-Ojeda, Godoy-Esquivel, Contreras-Hernández, Medina-Hernández, López-Caballero, Hernández-Pineda, Granados-Kraulles, Rodríguez-Vázquez, Torres-Valle, Cortés-Reyes, Medrano-López, Pérez-Gómez, Martínez-Ríos, Aguilar-De-los-Santos, Serafin-Díaz, Gutiérrez-Rivera, Merino-Pasaye, Vargas-Alarcón, Mata-Rocha, Sepúlveda-Robles, Rosas-Vargas, Hidalgo-Miranda and Mejía-Aranguré.)
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