Development of novel SSR molecular markers using a Next-Generation Sequencing approach (ddRADseq) in Stetsonia coryne (Cactaceae).

Autor: Gutiérrez AV; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Godoy Cruz 2290, 1425 Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Investigaciones Botánicas (LABIBO), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Salta, Avenida Bolivia 5150, 4400 Salta-Salta, Argentina.; Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (INTA-CONICET), formerly Instituto de Biotecnología, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Nicolás Repetto y de los Reseros s/n, B1686IGC, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Filippi CV; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Godoy Cruz 2290, 1425 Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (INTA-CONICET), formerly Instituto de Biotecnología, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Nicolás Repetto y de los Reseros s/n, B1686IGC, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Aguirre NC; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Godoy Cruz 2290, 1425 Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (INTA-CONICET), formerly Instituto de Biotecnología, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Nicolás Repetto y de los Reseros s/n, B1686IGC, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Puebla AF; Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (INTA-CONICET), formerly Instituto de Biotecnología, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Nicolás Repetto y de los Reseros s/n, B1686IGC, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Acuña CV; Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (INTA-CONICET), formerly Instituto de Biotecnología, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Nicolás Repetto y de los Reseros s/n, B1686IGC, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Taboada GM; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Godoy Cruz 2290, 1425 Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Investigaciones Botánicas (LABIBO), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Salta, Avenida Bolivia 5150, 4400 Salta-Salta, Argentina., Ortega-Baes FP; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Godoy Cruz 2290, 1425 Ciudad Autónoma de Buenos Aires, Argentina.; Laboratorio de Investigaciones Botánicas (LABIBO), Facultad de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Salta, Avenida Bolivia 5150, 4400 Salta-Salta, Argentina.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Anais da Academia Brasileira de Ciencias [An Acad Bras Cienc] 2021 Aug 30; Vol. 93 (suppl 3), pp. e20201778. Date of Electronic Publication: 2021 Aug 30 (Print Publication: 2021).
DOI: 10.1590/0001-3765202120201778
Abstrakt: The Cactaceae family is native to the American continent with several centers of diversity. In South America, one of these centers is the Central Andes and many species are considered to be threatened or vulnerable according to the International Union for Conservation of Nature (IUCN). Stetsonia coryne is an emblematic giant columnar cacti of the Chaco phytogeographic province. It has an extensive geographical distribution in many countries of the continent. However, to date there are no specific molecular markers for this species, neither reports of population genetic variability studies, such as for many cactus species. The lack of information is fundamentally due to the lack of molecular markers that allow these studies. In this work, by applying a Genotyping by Sequencing (GBS) technique, we developed polymorphic SSR markers for the Stetsonia coryne and evaluated their transferability to phylogenetically close species, in order to account for a robust panel of molecular markers for multispecies-studies within Cactaceae.
Databáze: MEDLINE
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