Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico.

Autor: Rodríguez-Maldonado AP; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Vázquez-Pérez JA; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Cedro-Tanda A; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Taboada B; Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Boukadida C; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias 'Ismael Cosío Villegas', Mexico City, Mexico., Wong-Arámbula C; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Nuñez-García TE; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Cruz-Ortiz N; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Barrera-Badillo G; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Hernández-Rivas L; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., López-Martínez I; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico., Mendoza-Vargas A; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Reyes-Grajeda JP; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Alcaraz N; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Peñaloza-Figueroa F; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Gonzalez-Barrera D; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Rangel-DeLeon D; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Herrera-Montalvo LA; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Mejía-Nepomuceno F; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Hernández-Terán A; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Mújica-Sánchez M; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Becerril-Vargas E; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Martínez-Orozco JA; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Pérez-Padilla R; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Salas-Hernández J; Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, Mexico City, Mexico., Sanchez-Flores A; Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Isa P; Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, Mexico., Matías-Florentino M; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias 'Ismael Cosío Villegas', Mexico City, Mexico., Ávila-Ríos S; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias 'Ismael Cosío Villegas', Mexico City, Mexico., Muñoz-Medina JE; Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico., Grajales-Muñiz C; Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico., Salas-Lais AG; Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico., Santos Coy-Arechavaleta A; Instituto Mexicano del Seguro Social, Mexico City, Mexico., Hidalgo-Miranda A; Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico. ahidalgo@inmegen.gob.mx., Arias CF; Centro de Investigación en Enfermedades Infecciosas, Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias 'Ismael Cosío Villegas', Mexico City, Mexico. arias@ibt.unam.mx., Ramírez-González JE; Dirección General de Epidemiología, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos 'Dr. Manuel Martínez Báez, Mexico City, Mexico. ernesto.ramirez@salud.gob.mx.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Archives of virology [Arch Virol] 2021 Nov; Vol. 166 (11), pp. 3173-3177. Date of Electronic Publication: 2021 Aug 27.
DOI: 10.1007/s00705-021-05208-6
Abstrakt: SARS-CoV-2 variants emerged in late 2020, and at least three variants of concern (B.1.1.7, B.1.351, and P1) have been reported by WHO. These variants have several substitutions in the spike protein that affect receptor binding; they exhibit increased transmissibility and may be associated with reduced vaccine effectiveness. In the present work, we report the identification of a potential variant of interest, harboring the mutations T478K, P681H, and T732A in the spike protein, within the newly named lineage B.1.1.519, that rapidly outcompeted the preexisting variants in Mexico and has been the dominant virus in the country during the first trimester of 2021.
(© 2021. The Author(s), under exclusive licence to Springer-Verlag GmbH Austria, part of Springer Nature.)
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