Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae Clones from Wild Chimpanzees and Termites in Senegal.

Autor:	Baron SA; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Mediannikov O; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Abdallah R; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Kuete Yimagou E; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Medkour H; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Dubourg G; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Elamire Y; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Afouda P; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Ngom II; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Angelakis E; Laboratory of Medical Microbiology, Hellenic Pasteur Institute, Athens, Greece., Davoust B; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France., Diatta G; VITROME IRD 257, Campus International de Recherche IRD-UCAD de Hann, Dakar, Sénégal., Barciela A; Jane Goodall Institute Spain and Senegal, Dindefelo Biological Station, Kedougou, Senegal., Hernandez-Aguilar RA; Jane Goodall Institute Spain and Senegal, Dindefelo Biological Station, Kedougou, Senegal.; Department of Social Psychology and Quantitative Psychology, Faculty of Psychology, University of Barcelona, Barcelona, Spain., Sokhna C; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France.; Research Unit on Emerging Infectious and Tropical Diseases, Institut de Recherche pour le Développement, Université de la Méditerranée, Marseille, France., Caputo A; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France., Levasseur A; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France., Rolain JM; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France., Raoult D; Aix Marseille Université, IRD, APHM, MEPHI, Faculté de Médecine et de Pharmacie, Marseille, France.; IHU Méditerranée Infection, Marseille, France.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	Antimicrobial agents and chemotherapy [Antimicrob Agents Chemother] 2021 Aug 17; Vol. 65 (9), pp. e0255720. Date of Electronic Publication: 2021 Aug 17.
DOI:	10.1128/AAC.02557-20
Abstrakt:	Antibiotic resistance genes exist naturally in various environments far from human usage. Here, we investigated multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae, a common pathogen of chimpanzees and humans. We screened antibiotic-resistant K. pneumoniae from 48 chimpanzee stools and 38 termite mounds ( n  = 415 samples) collected in protected areas in Senegal. The microsatellite method was used to identify chimpanzee individuals ( n  = 13). Whole-genome sequencing was performed on K. pneumoniae complex isolates to identify antibiotic-resistant genes and characterize clones. We found a high prevalence of carbapenem-resistant K. pneumoniae among chimpanzee isolates (18/48 samples from 7/13 individuals) and ceftriaxone resistance among both chimpanzee individuals (19/48) and termite mounds (7/415 termites and 3/38 termite mounds). The bla OXA-48 and the bla KPC-2 genes were carried by international pOXA-48 and pKPC-2 plasmids, respectively. The ESBL plasmid carried bla CTX-M-15 , bla TEM-1B , and bla OXA-1 genes. Genome sequencing of 56 isolates identified two major clones associated with hospital-acquired infections of K. pneumoniae (ST307 and ST147) in chimpanzees and termites, suggesting circulation of strains between the two species, as chimpanzees feed on termites. The source and selection pressure of these clones in this environment need to be explored.
Databáze:	MEDLINE
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