A host transcriptomic signature for identification of respiratory viral infections in the community.

Autor:	Almansa R; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Respiratorias (CIBERES), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., Herrero-Rodríguez C; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.; Unidad de Investigación en Atención Primaria de Salamanca (APISAL), Instituto de investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., Martínez-Huélamo M; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., Vicente-Andres MDP; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., Nieto-Barbero JA; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., Martín-Ballesteros M; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., Rodilla-Carvajal MDM; Servicio de Urgencias de Atención Primaria de Salamanca (SUAP). Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain., de la Fuente A; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain., Ortega A; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain., Alonso-Ramos MJ; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain., Wacker J; Inflammatix Inc., Burlingame, CA, USA., Liesenfeld O; Inflammatix Inc., Burlingame, CA, USA., Sweeney TE; Inflammatix Inc., Burlingame, CA, USA., Bermejo-Martin JF; Group for Biomedical Research in Sepsis (BioSepsis), Instituto de Investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia Regional de Salud, Salamanca, Spain.; Hospital Universitario Río Hortega, Gerencia Regional de Salud, Valladolid, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Respiratorias (CIBERES), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., García-Ortiz L; Unidad de Investigación en Atención Primaria de Salamanca (APISAL), Instituto de investigación Biomédica de Salamanca (IBSAL), Gerencia de Atención Primaria de Salamanca, Gerencia Regional de salud de Castilla y León (SACyL), Salamanca, Spain.; Departamento de Ciencias Biomédicas y del Diagnóstico, Universidad de Salamanca, Salamanca, Spain.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	European journal of clinical investigation [Eur J Clin Invest] 2021 Dec; Vol. 51 (12), pp. e13626. Date of Electronic Publication: 2021 Jun 13.
DOI:	10.1111/eci.13626
Abstrakt:	Background: Fever-7 is a test evaluating host mRNA expression levels of IFI27, JUP, LAX, HK3, TNIP1, GPAA1 and CTSB in blood able to detect viral infections. This test has been validated mostly in hospital settings. Here we have evaluated Fever-7 to identify the presence of respiratory viral infections in a Community Health Center. Methods: A prospective study was conducted in the "Servicio de Urgencias de Atención Primaria" in Salamanca, Spain. Patients with clinical signs of respiratory infection and at least one point in the National Early Warning Score were recruited. Fever-7 mRNAs were profiled on a Nanostring nCounter® SPRINT instrument from blood collected upon patient enrolment. Viral diagnosis was performed on nasopharyngeal aspirates (NPAs) using the Biofire-RP2 panel. Results: A respiratory virus was detected in the NPAs of 66 of the 100 patients enrolled. Median National Early Warning Score was 7 in the group with no virus detected and 6.5 in the group with a respiratory viral infection (P > .05). The Fever-7 score yielded an overall AUC of 0.81 to predict a positive viral syndromic test. The optimal operating point for the Fever-7 score yielded a sensitivity of 82% with a specificity of 71%. Multivariate analysis showed that Fever-7 was a robust marker of viral infection independently of age, sex, major comorbidities and disease severity at presentation (OR [CI95%], 3.73 [2.14-6.51], P < .001). Conclusions: Fever-7 is a promising host immune mRNA signature for the early identification of a respiratory viral infection in the community. (© 2021 The Authors. European Journal of Clinical Investigation published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of Stichting European Society for Clinical Investigation Journal Foundation.)
Databáze:	MEDLINE
Externí odkaz:	Zobrazit plný text záznamu Plný text ve formátu PDF