Genetic diversity and population structure of Cynara cardunculus L. in southern Portugal.

Autor: Castro MM; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal., Rosa D; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development - CEBAL, Beja, Portugal., Ferro AM; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development - CEBAL, Beja, Portugal., Faustino A; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development - CEBAL, Beja, Portugal., Paulino A; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; Centre for Ecology, Faculdade de Ciência, Evolution and Environmental Changes (cE3c), Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal., Brás T; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; LAQV/ REQUIMTE, FCT, Universidade Nova de Lisboa, Caparica, Portugal., Machado E; MED-Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Ambiente e Desenvolvimento, Universidade de Évora, Ap 94, Évora, Portugal., Cruz CP; Ambiente e Desenvolvimento & Departamento de Biologia, MED - Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Escola de Ciências e Tecnologia, Universidade de Évora, Ap 94, Évora, Portugal., Belo ADF; Ambiente e Desenvolvimento & Departamento de Biologia, MED - Instituto Mediterrâneo para a Agricultura, Escola de Ciências e Tecnologia, Universidade de Évora, Ap 94, Évora, Portugal., Nozes P; Departamento de Biociências/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal., Portugal J; Departamento de Biociências/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; VALORIZA - Centro de Investigação para a Valorização dos Recursos Endógenos, Instituto Politécnico de Portalegre, Portalegre, Portugal., Ramôa S; Departamento de Biociências/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal., Mendonça D; Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária I.P. (INIAV IP), Unidade Estratégica de Biotecnologia e Recursos Genéticos, I.P., Oeiras, Portugal., Simões F; Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária I.P. (INIAV IP), Unidade Estratégica de Biotecnologia e Recursos Genéticos, I.P., Oeiras, Portugal., Duarte MF; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development - CEBAL, Beja, Portugal., Marum L; Centro de Biotecnologia Agrícola e Agro-Alimentar do Alentejo (CEBAL)/Instituto Politécnico de Beja (IPBeja), Beja, Portugal.; MED - Mediterranean Institute for Agriculture, Environment and Development - CEBAL, Beja, Portugal.
Jazyk: angličtina
Zdroj: PloS one [PLoS One] 2021 Jun 09; Vol. 16 (6), pp. e0252792. Date of Electronic Publication: 2021 Jun 09 (Print Publication: 2021).
DOI: 10.1371/journal.pone.0252792
Abstrakt: Cynara cardunculus L. is a cardoon species native to the Mediterranean region, which is composed of three botanical taxa, each having distinct biological characteristics. The aim of this study was to examine wild populations of C. cardunculus established in Portugal, in order to determine their genetic diversity, geographic distribution, and population structure. Based on SSR markers, 121 individuals of C. cardunculus from 17 wild populations of the Portuguese Alentejo region were identified and analysed. Ten SSRs were found to be efficient markers in the genetic diversity analysis. The total number of alleles ranged from 9 to 17 per locus. The expected and observed means in heterozygosity, by population analysed, were 0.591 and 0.577, respectively. The wild population exhibited a high level of genetic diversity at the species level. The highest proportion of genetic variation was identified within a geographic group, while variation was lower among groups. Geographic areas having highest genetic diversity were identified in Alvito, Herdade da Abóboda, Herdade da Revilheira and Herdade de São Romão populations. Moreover, significant genetic differentiation existed between wild populations from North-Alentejo geographic locations (Arraiolos, Évora, Monte da Chaminé) and Centro Hortofrutícola, compared with other populations. This study reports genetic diversity among a representative number of wild populations and genotypes of C. cardunculus from Portugal. These results will provide valuable information towards future management of C. cardunculus germplasm.
Competing Interests: The authors have declared that no competing interests exist.
Databáze: MEDLINE
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