Crystal structure, Hirshfeld surface analysis and inter-action energy calculation of 1-decyl-2,3-di-hydro-1 H -benzimidazol-2-one.

Autor: Ait Elmachkouri Y; Laboratoire de Chimie Appliquée et Environnement, Equipe de Chimie Bioorganique Appliquée, Faculté des Sciences, Université Ibn Zohr, Agadir, Morocco.; Laboratoire de Chimie Organique Hétérocyclique URAC 21, Pôle de Compétence Pharmacochimie, Av. Ibn Battouta, BP 1014, Faculté des Sciences, Université Mohammed V, Rabat, Morocco., Saber A; Laboratoire de Chimie Organique Hétérocyclique URAC 21, Pôle de Compétence Pharmacochimie, Av. Ibn Battouta, BP 1014, Faculté des Sciences, Université Mohammed V, Rabat, Morocco., Irrou E; Laboratoire de Chimie Appliquée et Environnement, Equipe de Chimie Bioorganique Appliquée, Faculté des Sciences, Université Ibn Zohr, Agadir, Morocco.; Laboratoire de Chimie Organique Hétérocyclique URAC 21, Pôle de Compétence Pharmacochimie, Av. Ibn Battouta, BP 1014, Faculté des Sciences, Université Mohammed V, Rabat, Morocco., Amer B; Faculty of Medicine and Health Sciences, Sana'a University, San'a, Yemen., Mague JT; Department of Chemistry, Tulane University, New Orleans, LA 70118, USA., Hökelek T; Department of Physics, Hacettepe University, 06800 Beytepe, Ankara, Turkey., Labd Taha M; Laboratoire de Chimie Appliquée et Environnement, Equipe de Chimie Bioorganique Appliquée, Faculté des Sciences, Université Ibn Zohr, Agadir, Morocco., Sebbar NK; Laboratoire de Chimie Appliquée et Environnement, Equipe de Chimie Bioorganique Appliquée, Faculté des Sciences, Université Ibn Zohr, Agadir, Morocco.; Laboratoire de Chimie Organique Hétérocyclique URAC 21, Pôle de Compétence Pharmacochimie, Av. Ibn Battouta, BP 1014, Faculté des Sciences, Université Mohammed V, Rabat, Morocco., Essassi EM; Laboratoire de Chimie Organique Hétérocyclique URAC 21, Pôle de Compétence Pharmacochimie, Av. Ibn Battouta, BP 1014, Faculté des Sciences, Université Mohammed V, Rabat, Morocco.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Acta crystallographica. Section E, Crystallographic communications [Acta Crystallogr E Crystallogr Commun] 2021 Apr 27; Vol. 77 (Pt 5), pp. 559-563. Date of Electronic Publication: 2021 Apr 27 (Print Publication: 2021).
DOI: 10.1107/S2056989021004291
Abstrakt: The title mol-ecule, C 17 H 26 N 2 O, adopts an L-shaped conformation, with the straight n -decyl chain positioned nearly perpendicular to the di-hydro-benzimidazole moiety. The di-hydro-benzimidazole portion is not quite planar as there is a dihedral angle of 1.20 (6)° between the constituent planes. In the crystal, N-H⋯O hydrogen bonds form inversion dimers, which are connected into the three-dimensional structure by C-H⋯O hydrogen bonds and C-H⋯π(ring) inter-actions. Hirshfeld surface analysis indicates that the most important contributions for the crystal packing are from H⋯H (75.9%), H⋯C/C⋯H (12.5%) and H⋯O/O⋯H (7.0%) inter-actions. Based on computational chemistry using the CE-B3LYP/6-31 G(d,p) energy model, C-H⋯O hydrogen bond energies are -74.9 (for N-H⋯O) and -42.7 (for C-H⋯O) kJ mol -1 .
(© Ait Elmachkouri et al. 2021.)
Databáze: MEDLINE
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