The coding and long noncoding single-cell atlas of the developing human fetal striatum.

Autor: Bocchi VD; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Conforti P; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Vezzoli E; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Besusso D; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Cappadona C; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Lischetti T; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Galimberti M; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Ranzani V; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Bonnal RJP; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., De Simone M; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Rossetti G; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., He X; WT-MRC Cambridge Stem Cell Institute and Department of Clinical Neuroscience, University of Cambridge, Cambridge, UK., Kamimoto K; Department of Developmental Biology, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA.; Department of Genetics, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA.; Center of Regenerative Medicine, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA., Espuny-Camacho I; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Faedo A; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy., Gervasoni F; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy.; Dipartimento di Biotecnologie Mediche e Medicina Traslazionale, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy., Vuono R; WT-MRC Cambridge Stem Cell Institute and Department of Clinical Neuroscience, University of Cambridge, Cambridge, UK., Morris SA; Department of Developmental Biology, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA.; Department of Genetics, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA.; Center of Regenerative Medicine, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO 63110, USA., Chen J; CHDI Management/CHDI Foundation, New York, NY, USA., Felsenfeld D; CHDI Management/CHDI Foundation, New York, NY, USA., Pavesi G; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy., Barker RA; WT-MRC Cambridge Stem Cell Institute and Department of Clinical Neuroscience, University of Cambridge, Cambridge, UK., Pagani M; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy. elena.cattaneo@unimi.it massimiliano.pagani@unimi.it.; Dipartimento di Biotecnologie Mediche e Medicina Traslazionale, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy., Cattaneo E; Dipartimento di Bioscienze, Università degli Studi di Milano, Milan, Italy. elena.cattaneo@unimi.it massimiliano.pagani@unimi.it.; INGM, Istituto Nazionale Genetica Molecolare, Milan, Italy.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Science (New York, N.Y.) [Science] 2021 May 07; Vol. 372 (6542).
DOI: 10.1126/science.abf5759
Abstrakt: Deciphering how the human striatum develops is necessary for understanding the diseases that affect this region. To decode the transcriptional modules that regulate this structure during development, we compiled a catalog of 1116 long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs) identified de novo and then profiled 96,789 single cells from the early human fetal striatum. We found that D1 and D2 medium spiny neurons (D1- and D2-MSNs) arise from a common progenitor and that lineage commitment is established during the postmitotic transition, across a pre-MSN phase that exhibits a continuous spectrum of fate determinants. We then uncovered cell type-specific gene regulatory networks that we validated through in silico perturbation. Finally, we identified human-specific lincRNAs that contribute to the phylogenetic divergence of this structure in humans. This work delineates the cellular hierarchies governing MSN lineage commitment.
(Copyright © 2021 The Authors, some rights reserved; exclusive licensee American Association for the Advancement of Science. No claim to original U.S. Government Works.)
Databáze: MEDLINE
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