Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., a new member of the family Peptostreptococcaceae , isolated from human clinical samples.

Autor: Maheux AF; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Present address: AFM water consulting, Québec City (Québec), Canada., Boudreau DK; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Present address: Département de médecine, Centre de recherche de l'Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Abed JY; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Département de microbiologie-infectiologie et d'immunologie, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Bérubé È; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Brodeur S; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Present address: Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes (IBIS), Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Present address: Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des Sciences et de Génie, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Bernard KA; National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg (Manitoba), Canada.; Department of Medical Microbiology, University of Manitoba, Winnipeg (Manitoba), Canada., Hashimi A; Department of Microbiology and Immunology, Life Sciences Institute, The University of British Columbia, Vancouver (BC), Canada., Ducrey É; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Guay ÉF; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Raymond F; École de nutrition, Faculté des sciences de l'agriculture et de l'alimentation, Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels, Québec City (Québec), Canada., Corbeil J; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Département de médecine moléculaire, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Centre de recherche en données massives, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Domingo MC; Laboratoire de santé publique du Québec (LSPQ), Institut national de santé publique du Québec (INSPQ), Ste-Anne-de-Bellevue (Québec), Canada., Roy PH; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Département de biochimie, de microbiologie et de bio-informatique, Faculté des sciences et de génie, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Boissinot M; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Département de microbiologie-infectiologie et d'immunologie, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City (Québec), Canada., Tocheva EI; Department of Microbiology and Immunology, Life Sciences Institute, The University of British Columbia, Vancouver (BC), Canada., Omar RF; Centre de recherche en infectiologie de l'Université Laval, Axe Maladies infectieuses et immunitaires, Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval, Québec City (Québec), Canada.; Département de microbiologie-infectiologie et d'immunologie, Faculté de médecine, Université Laval, Québec City (Québec), Canada.
Jazyk: angličtina
Zdroj: International journal of systematic and evolutionary microbiology [Int J Syst Evol Microbiol] 2019 Jun; Vol. 71 (3). Date of Electronic Publication: 2021 Feb 15.
DOI: 10.1099/ijsem.0.004691
Abstrakt: A rod-shaped, motile anaerobic bacterium, designated CCRI-22567 T , was isolated from a vaginal sample of a woman diagnosed with bacterial vaginosis and subjected to a polyphasic taxonomic study. The novel strain was capable of growth at 30-42 °C (optimum, 42 °C), at pH 5.5-8.5 (optimum, pH 7.0-7.5) and in the presence of 0-1.5 % (w/v) NaCl (optimally at 0.5 % NaCl). The phylogenetic trees based on 16S rRNA gene sequences showed that strain CCRI-22567 T forms a distinct evolutionary lineage independent of other taxa in the family Peptostreptococcaceae . Strain CCRI-22567 T exhibited 90.1 % 16S rRNA gene sequence similarity to Peptoanaerobacter stomatis ACC19a T and 89.7 % to Eubacterium yurii subsp. schtitka ATCC 43716. The three closest organisms with an available whole genome were compared to strain CCRI-22567 T for genomic relatedness assessment. The genomic average nucleotide identities (OrthoANIu) obtained with Peptoanaerobacter stomatis ACC19a T , Eubacterium yurii subsp. margaretiae ATCC 43715 and Filifactor alocis ATCC 35896 T were 71.8, 70.3 and 69.6 %, respectively. Strain CCRI-22567 T contained C 18 : 1  ω9 c and C 18 : 1  ω9 c DMA as the major fatty acids. The DNA G+C content of strain CCRI-22567 T based on its genome sequence was 33.8 mol%. On the basis of the phylogenetic, chemotaxonomic and other phenotypic properties, strain CCRI-22567 T is considered to represent a new genus and species within the family Peptostreptococcaceae , for which the name Criibacterium bergeronii gen. nov., sp. nov., is proposed. The type strain of Criibacterium bergeronii is CCRI-22567 T (=LMG 31278 T =DSM 107614 T =CCUG 72594 T ).
Databáze: MEDLINE
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