SARSCOVIDB-A New Platform for the Analysis of the Molecular Impact of SARS-CoV-2 Viral Infection.

Autor:	da Rosa RL; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil., Yang TS; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Tureta EF; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil.; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., de Oliveira LRS; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Moraes ANS; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil., Tatara JM; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil., Costa RP; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Borges JS; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Alves CI; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Berger M; Centro de Pesquisa Experimental, Hospital de Clínicas de Porto Alegre, Rua Ramiro Barcelos, 2350, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90035-903, Brasil., Guimarães JA; Centro de Pesquisa Experimental, Hospital de Clínicas de Porto Alegre, Rua Ramiro Barcelos, 2350, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90035-903, Brasil., Santi L; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil.; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil., Beys-da-Silva WO; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Bento Gonçalves 9500, prédio 43431, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 91501-970, Brasil.; Faculdade de Farmácia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Avenida Ipiranga 2752, Porto Alegre, Rio Grande do Sul 90610-000, Brasil.
Jazyk:	angličtina
Zdroj:	ACS omega [ACS Omega] 2021 Jan 21; Vol. 6 (4), pp. 3238-3243. Date of Electronic Publication: 2021 Jan 21 (Print Publication: 2021).
DOI:	10.1021/acsomega.0c05701
Abstrakt:	The COVID-19 pandemic caused by the new coronavirus (SARS-CoV-2) has become a global emergency issue for public health. This threat has led to an acceleration in related research and, consequently, an unprecedented volume of clinical and experimental data that include changes in gene expression resulting from infection. The SARS-CoV-2 infection database (SARSCOVIDB: https://sarscovidb.org/) was created to mitigate the difficulties related to this scenario. The SARSCOVIDB is an online platform that aims to integrate all differential gene expression data, at messenger RNA and protein levels, helping to speed up analysis and research on the molecular impact of COVID-19. The database can be searched from different experimental perspectives and presents all related information from published data, such as viral strains, hosts, methodological approaches (proteomics or transcriptomics), genes/proteins, and samples (clinical or experimental). All information was taken from 24 articles related to analyses of differential gene expression out of 5,554 COVID-19/SARS-CoV-2-related articles published so far. The database features 12,535 genes whose expression has been identified as altered due to SARS-CoV-2 infection. Thus, the SARSCOVIDB is a new resource to support the health workers and the scientific community in understanding the pathogenesis and molecular impact caused by SARS-CoV-2. Competing Interests: The authors declare no competing financial interest. (© 2021 The Authors. Published by American Chemical Society.)
Databáze:	MEDLINE
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