A highly rifampicin resistant Mycobacterium tuberculosis strain emerging in Southern Brazil.

Autor: Rossetti ML; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular Aplicada a Saúde, Universidade Luterana do Brasil (ULBRA), Canoas, Rio Grande do Sul, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, RS, Brazil., Almeida da Silva PE; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica (NUPEMM), Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil., Salvato RS; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Centro de Biotecnologia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, RS, Brazil. Electronic address: richardsalvato@hotmail.com., Reis AJ; Núcleo de Pesquisa em Microbiologia Médica (NUPEMM), Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Rio Grande, Rio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil., Schiefelbein SH; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular Aplicada a Saúde, Universidade Luterana do Brasil (ULBRA), Canoas, Rio Grande do Sul, Brazil; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil., von Groll A; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular Aplicada a Saúde, Universidade Luterana do Brasil (ULBRA), Canoas, Rio Grande do Sul, Brazil., Barcellos RB; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil; Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, RJ, Brazil., Maschmann R; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil., Esteves LS; Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, RJ, Brazil., Spies F; Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CDCT), Centro Estadual de Vigilância em Saúde, Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil., Trespach RR; Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular Aplicada a Saúde, Universidade Luterana do Brasil (ULBRA), Canoas, Rio Grande do Sul, Brazil., Dalla Costa ER; Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, RJ, Brazil., Neubauer de Amorim HL; In Silico Solutions LTDA, Porto Alegre, RS, Brazil.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Tuberculosis (Edinburgh, Scotland) [Tuberculosis (Edinb)] 2020 Dec; Vol. 125, pp. 102015. Date of Electronic Publication: 2020 Oct 30.
DOI: 10.1016/j.tube.2020.102015
Abstrakt: Here we described phenotypical, molecular and epidemiological features of a highly rifampicin-resistant Mycobacterium tuberculosis strain emerging in Southern Brazil, that carries an uncommon insertion of 12 nucleotides at the codon 435 in the rpoB gene. Employing a whole-genome sequencing-based study on drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains, we identified this emergent strain in 16 (9.19%) from 174 rifampicin-resistant clinical strains, all of them belonging to LAM RD115 sublineage. Nine of these 16 strains were available to minimum inhibitory concentration determination and for all of them was found a high rifampicin-resistance level (≥to 32 mg/L). This high resistance level could be explained by structural changes into the RIF binding site of RNA polymerase caused by the insertions, and consequent low-affinity interaction with rifampicin complex confirmed through protein modeling and molecular docking simulations. Epidemiological investigation showed that most of the individuals (56.25%) infected by the studied strains were prison inmate individuals or that spent some time in prison. The phylogenomic approach revealed that strains carrying on insertion belonged to same genomic cluster, evidencing a communal transmission chain involving inmate individuals and community. We stress the importance of tuberculosis genomic surveillance and introduction of measures to interrupt Mycobacterium tuberculosis transmission chain in this region.
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Databáze: MEDLINE
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