Comprehensive Constitutional Genetic and Epigenetic Characterization of Lynch-Like Individuals.

Autor: Dámaso E; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., González-Acosta M; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Vargas-Parra G; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Navarro M; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Balmaña J; High Risk and Cancer Prevention Group, Vall d'Hebron Institute of Oncology (VHIO). Carrer de Natzaret 115-117, 08035 Barcelona, Spain., Ramon Y Cajal T; Medical Oncology Department, Hospital de Santa Creu i Sant Pau. Carrer de Sant Quintí 89, 08041 Barcelona, Spain., Tuset N; Genetic Counseling Unit, Hospital Arnau de Vilanova. Avinguda Alcalde Rovira Roure 80, 25198 Lleida, Spain., Thompson BA; Faculty of Medicine, Dentistry and Health Sciences, University of Melbourne. Building 181 Grattan St, VIC 3010 Melbourne, Australia., Marín F; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Fernández A; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Gómez C; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Velasco À; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain.; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Institut d'Investigació Biomèdica de Girona (IDIBGI). Carrer del Dr. Castany s/n, 17190 Salt, Girona, Spain., Solanes A; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Iglesias S; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Urgel G; Genetic Counseling Unit, Hospital Arnau de Vilanova. Avinguda Alcalde Rovira Roure 80, 25198 Lleida, Spain., López C; Medical Oncology Department, Hospital de Santa Creu i Sant Pau. Carrer de Sant Quintí 89, 08041 Barcelona, Spain., Del Valle J; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Campos O; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Santacana M; Pathology Department, Hospital Arnau de Vilanova, Institut de Recerca Biomèdica de Lleida (IRB Lleida). Avinguda Alcalde Rovira Roure 80, 25198 Lleida, Spain., Matias-Guiu X; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain.; Pathology Department, Hospital Arnau de Vilanova, Institut de Recerca Biomèdica de Lleida (IRB Lleida). Avinguda Alcalde Rovira Roure 80, 25198 Lleida, Spain.; Pathology Department, Bellvitge University Hospital, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL). Carrer de la Feixa Llarga s/n, 08907 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain., Lázaro C; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Valle L; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Brunet J; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain.; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Institut d'Investigació Biomèdica de Girona (IDIBGI). Carrer del Dr. Castany s/n, 17190 Salt, Girona, Spain.; Department of Medical Sciences, School of Medicine, University of Girona. Carrer Emili Grahit 77, 17003 Girona, Spain., Pineda M; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain., Capellá G; Hereditary Cancer Program, Catalan Institute of Oncology, Insititut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge (IDIBELL), ONCOBELL Program. Avinguda de la Gran Via de l'Hospitalet 199-203, 08908 L'Hospitalet de Llobregat, Barcelona, Spain.; Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer (CIBERONC), 28029 Madrid, Spain.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Cancers [Cancers (Basel)] 2020 Jul 05; Vol. 12 (7). Date of Electronic Publication: 2020 Jul 05.
DOI: 10.3390/cancers12071799
Abstrakt: The causal mechanism for cancer predisposition in Lynch-like syndrome (LLS) remains unknown. Our aim was to elucidate the constitutional basis of mismatch repair (MMR) deficiency in LLS patients throughout a comprehensive (epi)genetic analysis. One hundred and fifteen LLS patients harboring MMR-deficient tumors and no germline MMR mutations were included. Mutational analysis of 26 colorectal cancer (CRC)-associated genes was performed. Pathogenicity of MMR variants was assessed by splicing and multifactorial likelihood analyses. Genome-wide methylome analysis was performed by the Infinium Human Methylation 450K Bead Chip. The multigene panel analysis revealed the presence of two MMR gene truncating mutations not previously found. Of a total of 15 additional MMR variants identified, five -present in 6 unrelated individuals- were reclassified as pathogenic. In addition, 13 predicted deleterious variants in other CRC-predisposing genes were found in 12 probands. Methylome analysis detected one constitutional MLH1 epimutation, but no additional differentially methylated regions were identified in LLS compared to LS patients or cancer-free individuals. In conclusion, the use of an ad-hoc designed gene panel combined with pathogenicity assessment of variants allowed the identification of deleterious MMR mutations as well as new LLS candidate causal genes. Constitutional epimutations in non-LS-associated genes are not responsible for LLS.
Databáze: MEDLINE
Externí odkaz:
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje