Genomic surveillance of the Chikungunya Virus (CHIKV) in Northeast Brazil after the first outbreak in 2014.
| Autor: | Rodrigues AM; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Souza RRM; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Fonseca LMDS; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Rolo CA; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Carvalho RH; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Sardi SI; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Departamento de Biointeração, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil., Campos GS; Universidade Federal da Bahia, Laboratório de Virologia, Departamento de Biointeração, Instituto de Ciências da Saúde, Salvador, BA, Brasil. |
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| Jazyk: | angličtina |
| Zdroj: | Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical [Rev Soc Bras Med Trop] 2020 Jun 22; Vol. 53, pp. e20190583. Date of Electronic Publication: 2020 Jun 22 (Print Publication: 2020). |
| DOI: | 10.1590/0037-8682-0583-2019 |
| Abstrakt: | Introduction: We performed an epidemiological surveillance of the Chikungunya (CHIKV) lineages in Bahia after the 2014 East/Central/South African (ECSA) genotype outbreak. Methods: Reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), viral isolation, and phylogenetic analyses were conducted on serum samples from 605 patients with CHIKV-like symptoms during 2014-2018. Results: Of the 605 samples, 167 were CHIKV-positive. Viral isolation was achieved for 20 samples; their phylogenetic analysis (E2 protein) revealed the presence of ECSA lineage and reinforced the phylogenetic relationship between ECSA and Indian Ocean lineages. Conclusions: The genomic surveillance of CHIKV showed that only ECSA lineage circulated in Bahia since the 2014 outbreak. |
| Databáze: | MEDLINE |
| Externí odkaz: |
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