Origins, Admixture Dynamics, and Homogenization of the African Gene Pool in the Americas.
Autor: | Gouveia MH; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Instituto de Pesquisa Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Center for Research on Genomics and Global Health, National Human Genome Research Institute, Bethesda, MD., Borda V; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Leal TP; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Departamento de Estatística, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Moreira RG; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Laboratório de Genômica, Centro de Laboratórios Multiusuário (CELAM), ICB, UFMG, Belo Horizonte, MG, Brazil., Bergen AW; Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute (NCI), National Institutes of Health (NIH), Bethesda, MD., Kehdy FSG; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Laboratório de Hanseníase, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, RJ, Brazil., Alvim I; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Aquino MM; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Araujo GS; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Laboratório de Genética Humana e Médica, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Pará - Campus Guamá, Belém, PA, Brazil., Araujo NM; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Furlan V; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Instituto de Ciências Exatas e Tecnológicas, Universidade Federal de Viçosa, Campus UFV-Florestal, Florestal, MG, Brazil., Liboredo R; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Machado M; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute, Bethesda, MD., Magalhaes WCS; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Núcleo de Ensino e Pesquisas do Instituto Mário Penna - NEP-IMP, Bairro Luxemburgo, Belo Horizonte, MG, Brazil., Michelin LA; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Rodrigues MR; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Department of Genetics and Evolutionary Biology, Biosciences Institute, University of São Paulo, São Paulo, SP, Brazil., Rodrigues-Soares F; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Departamento de Patologia, Genética e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas e Naturais, Universidade Federal do Triângulo Mineiro, Uberaba, MG, Brazil., Sant Anna HP; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Melbourne Integrative Genomics, The University of Melbourne, Melbourne, VIC, Australia., Santolalla ML; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Scliar MO; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Human Genome and Stem Cell Research Center, Biosciences Institute, University of São Paulo, São Paulo, SP, Brazil., Soares-Souza G; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Zamudio R; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Zolini C; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Beagle, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Mosaico Translational Genomics Initiative, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil., Bortolini MC; Departamento de Genética, Instituto de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, RS, Brazil., Dean M; Cancer Genomics Research Laboratory, Frederick National Laboratory for Cancer Research, Frederick, MD., Gilman RH; Bloomberg School of Public Health, Johns Hopkins University, Baltimore, MD.; Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru., Guio H; Instituto Nacional de Salud, Lima, Peru., Rocha J; Departamento de Biologia, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, Porto, Portugal.; CIBIO/InBIO: Research Center in Biodiversity and Genetic Resources, Vairão, Portugal., Pereira AC; Instituto do Coração, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP, Brazil., Barreto ML; Instituto de Saúde Coletiva, Universidade Federal da Bahia, Salvador, BA, Brazil.; Center of Data and Knowledge Integration for Health (CIDACS), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Salvador, Brazil., Horta BL; Programa de Pós-Graduação em Epidemiologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, RS, Brazil., Lima-Costa MF; Instituto de Pesquisa Rene Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, Belo Horizonte, MG, Brazil., Mbulaiteye SM; Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute (NCI), National Institutes of Health (NIH), Bethesda, MD., Chanock SJ; Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute (NCI), National Institutes of Health (NIH), Bethesda, MD., Tishkoff SA; Department of Genetics and Department of Biology, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA., Yeager M; Cancer Genomics Research Laboratory, Frederick National Laboratory for Cancer Research, Frederick, MD., Tarazona-Santos E; Departamento de Genética, Ecologia e Evolução, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Mosaico Translational Genomics Initiative, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil.; Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru.; Instituto de Estudos Avançados Transdisciplinares, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, MG, Brazil. |
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Jazyk: | angličtina |
Zdroj: | Molecular biology and evolution [Mol Biol Evol] 2020 Jun 01; Vol. 37 (6), pp. 1647-1656. |
DOI: | 10.1093/molbev/msaa033 |
Abstrakt: | The Transatlantic Slave Trade transported more than 9 million Africans to the Americas between the early 16th and the mid-19th centuries. We performed a genome-wide analysis using 6,267 individuals from 25 populations to infer how different African groups contributed to North-, South-American, and Caribbean populations, in the context of geographic and geopolitical factors, and compared genetic data with demographic history records of the Transatlantic Slave Trade. We observed that West-Central Africa and Western Africa-associated ancestry clusters are more prevalent in northern latitudes of the Americas, whereas the South/East Africa-associated ancestry cluster is more prevalent in southern latitudes of the Americas. This pattern results from geographic and geopolitical factors leading to population differentiation. However, there is a substantial decrease in the between-population differentiation of the African gene pool within the Americas, when compared with the regions of origin from Africa, underscoring the importance of historical factors favoring admixture between individuals with different African origins in the New World. This between-population homogenization in the Americas is consistent with the excess of West-Central Africa ancestry (the most prevalent in the Americas) in the United States and Southeast-Brazil, with respect to historical-demography expectations. We also inferred that in most of the Americas, intercontinental admixture intensification occurred between 1750 and 1850, which correlates strongly with the peak of arrivals from Africa. This study contributes with a population genetics perspective to the ongoing social, cultural, and political debate regarding ancestry, admixture, and the mestizaje process in the Americas. (© The Author(s) 2020. Published by Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution. All rights reserved. For permissions, please e-mail: journals.permissions@oup.com.) |
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