Physical and functional interplay between PCNA DNA clamp and Mre11-Rad50 complex from the archaeon Pyrococcus furiosus.

Autor: Hogrel G; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Lu Y; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Laurent S; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Henry E; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Etienne C; Université de Toulouse; UPS, 118 Route de Narbonne, F-31062 Toulouse, France; CNRS; LMGM; F-31062 Toulouse, France., Phung DK; Université de Toulouse; UPS, 118 Route de Narbonne, F-31062 Toulouse, France; CNRS; LMGM; F-31062 Toulouse, France., Dulermo R; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Bossé A; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Pluchon PF; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France., Clouet-d'Orval B; Université de Toulouse; UPS, 118 Route de Narbonne, F-31062 Toulouse, France; CNRS; LMGM; F-31062 Toulouse, France., Flament D; Ifremer, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; Université de Bretagne Occidentale, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.; CNRS, UMR6197, Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes, 29280 Plouzané, France.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Nucleic acids research [Nucleic Acids Res] 2018 Jun 20; Vol. 46 (11), pp. 5651-5663.
DOI: 10.1093/nar/gky322
Abstrakt: Several archaeal species prevalent in extreme environments are particularly exposed to factors likely to cause DNA damages. These include hyperthermophilic archaea (HA), living at temperatures >70°C, which arguably have efficient strategies and robust genome guardians to repair DNA damage threatening their genome integrity. In contrast to Eukarya and other archaea, homologous recombination appears to be a vital pathway in HA, and the Mre11-Rad50 complex exerts a broad influence on the initiation of this DNA damage response process. In a previous study, we identified a physical association between the Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA) and the Mre11-Rad50 (MR) complex. Here, by performing co-immunoprecipitation and SPR analyses, we identified a short motif in the C- terminal portion of Pyrococcus furiosus Mre11 involved in the interaction with PCNA. Through this work, we revealed a PCNA-interaction motif corresponding to a variation on the PIP motif theme which is conserved among Mre11 sequences of Thermococcale species. Additionally, we demonstrated functional interplay in vitro between P. furiosus PCNA and MR enzymatic functions in the DNA end resection process. At physiological ionic strength, PCNA stimulates MR nuclease activities for DNA end resection and promotes an endonucleolytic incision proximal to the 5' strand of double strand DNA break.
Databáze: MEDLINE