Taxonogenomic description of four new Clostridium species isolated from human gut: 'Clostridium amazonitimonense' , 'Clostridium merdae' , 'Clostridium massilidielmoense' and 'Clostridium nigeriense' .

Autor: Alou MT; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Ndongo S; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Frégère L; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Labas N; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Andrieu C; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Richez M; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Couderc C; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Baudoin JP; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Abrahão J; Laboratório de Vírus, Departamento de Microbiologia, Universidade Federal de Minas Gerais, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil., Brah S; Hopital National de Niamey, BP 247, Niamey, Niger., Diallo A; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.; Campus Commun UCAD-IRD of Hann, Route des pères Maristes, Hann Maristes, BP 1386, CP 18524, Dakar, Senegal., Sokhna C; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.; Campus Commun UCAD-IRD of Hann, Route des pères Maristes, Hann Maristes, BP 1386, CP 18524, Dakar, Senegal., Cassir N; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., La Scola B; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Cadoret F; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France., Raoult D; Aix-Marseille Université, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM63, CNRS 7278, IRD 198, INSERM 1095, Marseille, France.; Special Infectious Agents Unit, King Fahd Medical Research Center, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia.
Jazyk: angličtina
Zdroj: New microbes and new infections [New Microbes New Infect] 2017 Nov 22; Vol. 21, pp. 128-139. Date of Electronic Publication: 2017 Nov 22 (Print Publication: 2018).
DOI: 10.1016/j.nmni.2017.11.003
Abstrakt: Culturomics investigates microbial diversity of the human microbiome by combining diversified culture conditions, matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry and 16S rRNA gene identification. The present study allowed identification of four putative new Clostridium sensu stricto species: 'Clostridium amazonitimonense' strain LF2 T , 'Clostridium massilidielmoense' strain MT26 T , 'Clostridium nigeriense' strain Marseille-P2414 T and 'Clostridium merdae' strain Marseille-P2953 T , which we describe using the concept of taxonogenomics. We describe the main characteristics of each bacterium and present their complete genome sequence and annotation.
Databáze: MEDLINE
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