GEJ cancers: gastric or esophageal tumors? searching for the answer according to molecular identity.
Autor: | Barra WF; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Moreira FC; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Pereira Cruz AM; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Khayat AS; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Calcagno DQ; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Carneiro Dos Santos NP; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Mascarenhas Junior RW; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Thomaz Araújo TM; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Ishak G; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil.; Hospital Universitário João de Barros Barreto, Universidade Federal do Pará, Brazil., Demachki S; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Rodríguez Burbano RM; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Campos Ribeiro Dos Santos ÂK; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Batista Dos Santos SE; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil., Riggins GJ; Brain Cancer Biology and Therapy Research Laboratory, Johns Hopkins Medicine, Baltimore, MD, USA., Pimentel de Assumpção P; Núcleo de Pesquisas em Oncologia, Universidade Federal do Pará, Brazil. |
---|---|
Jazyk: | angličtina |
Zdroj: | Oncotarget [Oncotarget] 2017 Oct 31; Vol. 8 (61), pp. 104286-104294. Date of Electronic Publication: 2017 Oct 31 (Print Publication: 2017). |
DOI: | 10.18632/oncotarget.22216 |
Abstrakt: | The 7th edition of Union for International Cancer Control (UICC) staging system moved gastroesophageal junction (GEJ) cancers from gastric to esophageal group. Since clinical management is strongly influenced by this staging system, we looked at molecular fingerprints of GEJ tumors and compared to gastric and esophageal profiles. We aimed at elucidating whether GEJ cancers cluster with gastric or esophageal groups according to mRNA and microRNA expression pattern, since this might represent tumor identity. The clinical and expression data were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA) with 395 stomach, 184 esophagus and 521 colon samples for mRNA analyses and 392 stomach, 175 esophagus and 459 colon samples for microRNA comparisons. Both Principal Component Analysis (PCA) and Heat Map plots were performed in R platform, using Log Competing Interests: CONFLICTS OF INTEREST The authors declare that they have no conflicts of interest. |
Databáze: | MEDLINE |
Externí odkaz: |