Gene Expression Profiling of Acute Lymphoblastic Leukemia in Children with Very Early Relapse.

Autor: Núñez-Enríquez JC; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Bárcenas-López DA; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Mexico City, Mexico., Hidalgo-Miranda A; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Mexico City, Mexico., Jiménez-Hernández E; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General 'Gaudencio González Garza', Centro Médico Nacional (CMN) 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Bekker-Méndez VC; Unidad de Investigación Médica en Inmunología e Infectología, Hospital de Infectología 'Dr. Daniel Méndez Hernández', 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Flores-Lujano J; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Solis-Labastida KA; Servicio de Hematología Pediátrica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Martínez-Morales GB; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Sánchez-Muñoz F; Departamento de Inmunología, Instituto Nacional de Cardiología 'Ignacio Chávez' (INCICh), Mexico City, Mexico., Espinoza-Hernández LE; Servicio de Hematología Pediátrica, Hospital General 'Gaudencio González Garza', Centro Médico Nacional (CMN) 'La Raza', IMSS, Mexico City, Mexico., Velázquez-Aviña MM; Servicio de Onco-Pediatria, Hospital Juárez de México, Secretaria de Salud (SSa), Mexico City, Mexico., Merino-Pasaye LE; Servicio de Hematología Pediátrica, Centro Médico Nacional (CMN) '20 de Noviembre', Instituto de Seguridad Social al Servicio de los Trabajadores del Estado (ISSSTE), Mexico City, Mexico., García Velázquez AJ; Servicio de Oncología, Hospital Pediátrico de Moctezuma, Secretaría de Salud del D.F., Mexico City, Mexico., Pérez-Saldívar ML; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico., Mojica-Espinoza R; Unidad de Genotipificación y Análisis de Expresión, Instituto Nacional de Medicina Genómica, Mexico City, Mexico., Ramírez-Bello J; Unidad de Investigación de Enfermedades Metabólicas y Endócrinas, Hospital Juárez de México, Mexico City, Mexico., Jiménez-Morales S; Laboratorio de Genómica del Cáncer, Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN), Mexico City, Mexico. Electronic address: sjimenez@inmegen.gob.mx., Mejía-Aranguré JM; Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, UMAE Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional (CMN) 'Siglo XXI', Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico; Coordinación de Investigación en Salud, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), Mexico City, Mexico. Electronic address: juan.mejiaa@imss.gob.mx.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Archives of medical research [Arch Med Res] 2016 Nov; Vol. 47 (8), pp. 644-655.
DOI: 10.1016/j.arcmed.2016.12.005
Abstrakt: Background and Aims: Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most common childhood cancer worldwide. Mexican patients have high mortality rates, low frequency of good prognosis biomarkers (i.e., ETV6-RUNX1) and a high proportion is classified at the time of diagnosis with a high risk to relapse according to clinical features. In addition, very early relapses are more frequently observed than in other populations. The aim of the study was to identify new potential biomarkers associated with very early relapse in Mexican ALL children through transcriptome analysis.
Methods: Microarray gene expression profiling on bone marrow samples of 54 pediatric ALL patients, collected at time of diagnosis and/or at relapse, was performed. Eleven patients presented relapse within the first 18 months after diagnosis. Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0 (HTA 2.0) was used to perform gene expression analysis. Annotation and functional enrichment analyses were carried out using Gene Ontology, KEGG pathway analysis and Ingenuity Pathway Analysis tools.
Results: BLVRB, ZCCHC7, PAX5, EBF1, TMOD1 and BLNK were differentially expressed (fold-change >2.0 and p value <0.01) between relapsed and non-relapsed patients. Functional analysis of abnormally expressed genes revealed their important role in cellular processes related to the development of hematological diseases, cancer, cell death and survival and in cell-to-cell signaling interaction.
Conclusions: Our data support previous findings showing the relevance of PAX5, EBF1 and ZCCHC7 as potential biomarkers to identify a subgroup of ALL children in high risk to relapse.
(Copyright © 2016 IMSS. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.)
Databáze: MEDLINE
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