| Autor: |
Goldfarb M; Laboratório de Biologia Molecular de Plantas, Instituto de Biotecnologia Aplicada (BIOAGRO), Universidade Federal de Viçosa (UFV), 36570-000, Viçosa, MG, Brazil., Santana MF; Laboratório de Genética Molecular e de Microrganismo, Instituto de Biotecnologia Aplicada (BIOAGRO), Universidade Federal de Viçosa (UFV), 36570-000, Viçosa, MG, Brazil., Salomão TM; Laboratório de Biologia Molecular de Insetos, Departamento de Biologia Geral, Universidade Federal de Viçosa (UFV), 36570-000, Viçosa, MG, Brazil., Queiroz MV; Laboratório de Genética Molecular e de Microrganismo, Instituto de Biotecnologia Aplicada (BIOAGRO), Universidade Federal de Viçosa (UFV), 36570-000, Viçosa, MG, Brazil., Barros EG; Laboratório de Ciências Genômicas e Biotecnologia, Universidade Católica de Brasília, 70790-160, Brasília, DF, Brazil. |
| Abstrakt: |
Two retrotransposons from the superfamilies Copia and Gypsy named as Copia-LTR_SS and Gypsy-LTR_SS, respectively, were identified in the genomic bank of Sclerotinia sclerotiorum. These transposable elements (TEs) contained direct and preserved long terminal repeats (LTR). Domains related to codified regions for gag protein, integrase, reverse transcriptase and RNAse H were identified in Copia-LTR_SS, whereas in Gypsy-LTR_SS only domains for gag, reverse transcriptase and RNAse H were found. The abundance of identified LTR-Solo suggested possible genetic recombination events in the S. sclerotiorum genome. Furthermore, alignment of the sequences for LTR elements from each superfamily suggested the presence of a RIP (repeat-induced point mutation) silencing mechanism that may directly affect the evolution of this species. |
