mRNA and protein dataset of autophagy markers (LC3 and p62) in several cell lines.

Autor: Gómez-Sánchez R; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Department of Cell Biology, University of Groningen, University Medical Center Groningen, A. Deusinglaan 1, 9713 AV Groningen, The Netherlands., Yakhine-Diop SM; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Rodríguez-Arribas M; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Bravo-San Pedro JM; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Equipe 11 labellisée Ligue contre le Cancer, Centre de Recherche des Cordeliers, 75006 Paris, France; INSERM U1138, 75006 Paris, France; Université Paris Descartes/Paris V, Sorbonne Paris Cité, 75006 Paris, France; Université Pierre et Marie Curie/Paris VI, 75006 Paris, France; Gustave Roussy Comprehensive Cancer Institute, 94805 Villejuif, France., Martínez-Chacón G; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Uribe-Carretero E; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Pinheiro de Castro DC; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Pizarro-Estrella E; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., Fuentes JM; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain., González-Polo RA; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Neurodegenerativas (CIBERNED), Spain; Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Genética. Facultad de Enfermería y Terapia Ocupacional. Avda de la Universidad S/N C.P, 10003 Cáceres, Spain.
Jazyk: angličtina
Zdroj: Data in brief [Data Brief] 2016 Mar 09; Vol. 7, pp. 641-7. Date of Electronic Publication: 2016 Mar 09 (Print Publication: 2016).
DOI: 10.1016/j.dib.2016.02.085
Abstrakt: We characterized the dynamics of autophagy in vitro using four different cell systems and analyzing markers widely used in this field, i.e. LC3 (microtubule-associated protein 1 light chain 3; protein recruited from the cytosol (LC3-I) to the autophagosomal membrane where it is lipidated (LC3-II)) and p62/SQSTM1 (adaptor protein that serves as a link between LC3 and ubiquitinated substrates), (Klionsky et al., 2016) [1]. Data provided include analyses of protein levels of LC3 and p62 by Western-blotting and endogenous immunofluorescence experiments, but also p62 mRNA levels obtained by quantitative PCR (qPCR). To monitor the turnover of these autophagy markers and, thus, measure the flux of this pathway, cells were under starvation conditions and/or treated with bafilomycin A1 (Baf. A1) to block fusion of autophagosomes with lysosomes.
Databáze: MEDLINE
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