Identificação de potenciais biomarcadores No colesteatoma adquirido

Autor: ARAÚJO, Juliana Gusmão De
Jazyk: Breton
Rok vydání: 2012
Předmět:
Zdroj: Repositório Institucional da UFPEUniversidade Federal de PernambucoUFPE.
Druh dokumentu: masterThesis
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O colesteatoma adquirido, mesmo com os conhecimentos acumulados desde sua primeira descrição, ainda se mantém como um problema de saúde pública distante de ser solucionado. O entendimento mais profundo da patogênese do colesteatoma é de extrema importância visto que a natureza desta lesão é destrutiva e causadora de complicações potencialmente graves. Apesar das teorias propostas e das várias proteínas terem sido identificados no colesteatoma, a verdadeira etiopatogenia da doença ainda carece de investigações. Objetivo: Identificar biomarcadores do colesteatoma adquirido utilizando a plataforma proteômica. Casuística e Métodos: Foram coletadas amostras de colesteatoma e também fragmento de pele da região retroauricular de 12 indivíduos submetidos a cirurgia para remoção do colesteatoma. As amostras foram armazenadas em solução salina e mantidas a -20ºC até pesagem tecidual e extração das proteínas. Eletroforese bidimensional foi realizada, os géis foram corados com nitrato de prata e suas imagens digitalizadas. Todas as análises foram realizadas em triplicatas. Os peptídeos extraídos após a digestão do spots foram levados à espectrometria de massa e os espectros obtidos foram analisados usando o algoritmo Mascot utilizando os bancos de dados de proteína do NCBI e SwissProt. Resultados: Dos 393 spots identificados na análise do extrato proteico de colesteatoma adquirido, apenas 10 estavam dentro dos parâmetros estatísticos aceitáveis pelo algoritmo Mascot. As principais proteínas detectadas no colesteatoma adquirido foram a cadeia beta do fibrinogênio, proteína da matriz extracelular 2, actina citoplasmática 1, heparan sulfato glucosamina 3-O-sulfotransferase 3A1, fator de necrose tumoral alfa induzido proteína 8-like 1, Stanniocalcina-2, lisofosfolipase eosinofílica e OFUT1.Conclusão: Foram identificadas proteínas envolvidas com a migração celular, regulação da apoptose, vias de sinalização, hiperproliferação celular, cicatrização e processos inflamatórios. Pudemos, desta maneira, traçar um perfil proteômico do colesteatoma adquirido.
The acquired cholesteatoma, even with all the knowledge accumulated since its first description, still remains a public health problem, far from being solved. A deeper understanding of its pathogenesis is extremely important since it is a destructive lesion that might cause potentially serious complications. Several proteins have been identified in cholesteatoma and a few theories were described, however the true etiology of the disease still needs investigation. Objective: Identify acquired cholesteatoma biomarkers using proteomics platform. Patients and methods: Cholesteatoma samples were collected and also a skin fragment of the surgical incision of twelve patients undergoing surgery for cholesteatoma removal. The samples were stored in saline solution and kept at -20 ° C until weighing tissue and proteins extraction. Two-dimensional electrophoresis was conducted, the gels were stained with silver nitrate and their images were digitized. All analyzes were performed in triplicate. The peptides extracted after spots digestion were taken to mass spectrometry and the spectra obtained were analyzed using the Mascot algorithm comparing databases of the NCBI and SwissProt protein. Results: Of the 393 spots identified in the analysis of protein extracts of acquired cholesteatoma, only 10 were within acceptable statistical parameters by Mascot algorithm. The proteins detected in acquired cholesteatoma were fibrinogen beta chain, extracellular matrix protein 2, actin cytoplasmic 1, heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 3A1, tumor necrosis factor alpha 8 induced proteinlike 1, stanniocalcin-2, eosinophil lysophospholipase and OFUT1. Conclusion: Proteins involved in cell migration, regulation of apoptosis, signaling pathways, cellular proliferation, wound healing and inflammatory processes were identified. We were able to draw a proteomic profile of acquired cholesteatoma.
Databáze: Networked Digital Library of Theses & Dissertations
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