تجزیه و تحلیل مجموعه های ژنی جهت شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی مرتبط با صفات وزن بدن در مرغ
| Autor: | امیر حسین خلت آبادی فراهانی, حسین محمدی, محمد حسین مرادی, حسینعلی قاسمی, ایمان حاج خدادادی |
|---|---|
| Jazyk: | perština |
| Rok vydání: | 2020 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | تحقیقات تولیدات دامی, Vol 9, Iss 3, Pp 47-57 (2020) |
| Druh dokumentu: | article |
| ISSN: | 2252-0872 2538-6107 |
| DOI: | 10.22124/ar.2020.14917.1467 |
| Popis: | این پژوهش به منظور مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاههای ژنی مؤثر بر وزن بدن در سنین مختلف چهار نژاد مرغ چوآ، سیلک، لنگشن و بیرد با استفاده از آرایههای ژنومی با تراکم بالا انجام شد. اطلاعات رکوردهای فنوتیپی و ژنوتیپی نمونهها از پایگاه ذخیره ژنومی برخط Frontiersin استفاده شد. مطالعه پویش کل ژنومی از 402 قطعه مرغ و خروس با صفات وزن بدن از هفته اول تا 15 هفتگی در برنامه GenABEL ارزیابی شد. در مرحله بعد، تجزیه غنیسازی مجموعه ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی عملکرد زیستی ژنهای نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا با پایگاههای GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. در این پژوهش، تعداد 10 نشانگر تک نوکلئوتیدی واقع روی کروموزومهای 1، 2، 5، 7، 10، 14، 18، 19، 20 و 27 شناسایی شدند که با ژنهای ABCG1، MYOD1، MYH10، MYH11، MYO1B، MYO1C، MYO1E، MYL1، MYL2، MYL3، SLC2A8، ACACA، ACOX1، ACOX2 و PNPLA2 مرتبط بودند. برخی از این ژنها در مناطق معنیدار با مطالعات قبلی همخوانی داشتند. در تجزیه غنیسازی مجموعه ژنی، تعداد 17 مسیر هستیشناسی ژنی و بیوشیمیایی با صفات وزن بدن شناسایی شدند (01/0P˂). از این بین، مسیرهای cytoskeletal protein binding،anatomical structure development و Tricarboxylic acid cycle نقش مهمی در توسعه الیاف عضلانی اسکلتی و سوخت و ساز چربی داشتند. با توجه به تأیید مناطق قبلی پویش ژنومی صفات وزن بدن و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافتههای این تحقیق میتواند سبب تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامههای اصلاح نژادی مرغ شود. |
| Databáze: | Directory of Open Access Journals |
| Externí odkaz: |
|