Compositional epistasis detection using a few prototype disease models.

Autor:	Lu Cheng, Mu Zhu
Jazyk:	angličtina
Rok vydání:	2019
Předmět:	Medicine Science
Zdroj:	PLoS ONE, Vol 14, Iss 3, p e0213236 (2019)
Druh dokumentu:	article
ISSN:	1932-6203
DOI:	10.1371/journal.pone.0213236
Popis:	We study computational approaches for detecting SNP-SNP interactions that are characterized by a set of "two-locus, two-allele, two-phenotype and complete-penetrance" disease models. We argue that existing methods, which use data to determine a best-fitting disease model for each pair of SNPs prior to screening, may be too greedy. We present a less greedy strategy which, for each given pair of SNPs, limits the number of candidate disease models to a set of prototypes determined a priori.
Databáze:	Directory of Open Access Journals
Externí odkaz:	https://doaj.org/article/c15803076e3e4808927f05998b6d75c5 Zobrazit plný text záznamu View record in DOAJ Plný text ve formátu PDF Plný text ve formátu HTML
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje	K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.