Revisiting Chameleon Sequences in the Protein Data Bank

Autor:	Mihaly Mezei
Jazyk:	angličtina
Rok vydání:	2018
Předmět:	chameleon sequence residue propensity Protein Data Bank Industrial engineering. Management engineering T55.4-60.8 Electronic computers. Computer science QA75.5-76.95
Zdroj:	Algorithms, Vol 11, Iss 8, p 114 (2018)
Druh dokumentu:	article
ISSN:	1999-4893
DOI:	10.3390/a11080114
Popis:	The steady growth of the Protein Data Bank (PDB) suggests the periodic repetition of searches for sequences that form different secondary structures in different protein structures; these are called chameleon sequences. This paper presents a fast (nlog(n)) algorithm for such searches and presents the results on all protein structures in the PDB. The longest such sequence found consists of 20 residues.
Databáze:	Directory of Open Access Journals
Externí odkaz:	https://doaj.org/article/0eea4012e50a492fba9e990934eadb98 Zobrazit plný text záznamu View record in DOAJ Plný text ve formátu PDF Plný text ve formátu HTML
Nepřihlášeným uživatelům se plný text nezobrazuje	K zobrazení výsledku je třeba se přihlásit.