Biochemical and molecular identification of root-knot nematodes in greenhouse vegetable areas of Eastern Mediterranean Region (Turkey)

Autor: ASLAN, Ayşenur, ELEKCİOĞLU, İbrahim Halil
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2022
Předmět:
Zdroj: Volume: 46, Issue: 1 115-127
Turkish Journal of Entomology
ISSN: 1010-6960
2536-491X
Popis: Kök ur nematodu sürvey çalışmaları Doğu Akdeniz Bölgesi (Türkiye)’nde bulunan Mersin, Hatay ve Adana illerinde yoğun olarak sebze üretimi yapılan sera alanlarını kapsayacak şekilde 2017 ve 2018 yılı üretim sezonu boyunca yapılmıştır. Biyokimyasal ve moleküler tanılama teknikleri kullanılarak toplam 46 kök-ur nematodu popülasyonu karakterize edilmiştir. DNA ekstraksiyonu ikinci dönem larvalardan yapılmış olup, SCAR primerleri kullanılarak yapılan moleküler analizde Meloidogyne arenaria (Neal, 1889) Chitwood, 1949, Meloidogyne javanica (Treub) Chitwood, 1949, Meloidogyne incognita (Kofoid & White, 1919) Chitwood, 1949, Meloidogyne hapla Chitwood, 1949 ve Meloidogyne ethiopica Whitehead, 1968 (Nematoda: Heteroderidae) türleri taranmıştır. Sonuçlar incelendiğinde, otuz dokuz bölgeden elde edilen örnekler M. incognita (%85) olarak, yedi örnek ise M. javanica (%15) olarak tespit edilmiştir. Ek olarak, polyacrylamide jel elektroforez tanılama yöntemi kullanılarak tüm bölgelerden elde edilen genç dişi bireyler biyokimyasal olarak analiz edilmiştir. Meloidogyne incognita, M. javanica ve M. ethiopica grubu tanılamak için esteraz enzim profiline bakılmıştır. Meloidogyne incognita popülasyonlarında %62 oranında esteraz fenotip I1 bandı, %39 oranında ise esteraz fenotip I2 bandı gözlenmiştir. Bütün M. javanica popülasyonlarında esteraz fenotip J3 bandı tespit edilmiştir. Meloidogyne javanica ve M. incognita, Doğu Akdeniz Bölgesi’nde moleküler ve biyokimyasal yöntemlerle tanılanmış olup, bu iki yöntemden elde edilen sonuçlar birbirini desteklemektedir.
Root-knot nematode surveys were conducted during the growing seasons of 2017 and 2018 to cover the greenhouse vegetable areas in Mersin, Hatay and Adana Provinces in the Eastern Mediterranean Region (Turkey). A total of 46 root-knot nematode populations were characterized using biochemical and molecular diagnostic techniques. DNA extraction was done from second-stage juvenile and in molecular tests using SCAR primers, Meloidogyne arenaria (Neal, 1889) Chitwood, 1949, Meloidogyne javanica (Treub) Chitwood, 1949, Meloidogyne incognita (Kofoid & White, 1919) Chitwood, 1949, Meloidogyne hapla Chitwood, 1949 and Meloidogyne ethiopica Whitehead, 1968 (Tylenchida: Meloidogynidae) species were screened. Samples obtained from thirty-nine regions were identified as M. incognita (85%) and seven as M. javanica (15%). In addition, young females obtained from all regions were biochemically analyzed using the polyacrylamide gel electrophoresis diagnostic method. The esterase enzyme profile was examined to identify the M. incognita, M. javanica and M. ethiopica groups. Esterase phenotype I1 band was observed in 62% of M. incognita populations and esterase phenotype I2 band was observed in 39%. Esterase phenotype J3 band was detected in all M. javanica populations. M. javanica and M. incognita were verified and also supported by molecular and biochemical methods in the Eastern Mediterranean Region.
Databáze: OpenAIRE
Externí odkaz: