Host-specific competitiveness to form nodules in Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae

Autor: Boivin, Stéphane, Ait Lahmidi, Nassima, Sherlock, David, Bonhomme, Maxime, Dijon, Doriane, Heulin-Gotty, Karine, LE QUERE, Antoine, Pervent, Marjorie, Tauzin, Marc, Carlsson, Georg, Jensen, Erik, Journet, Etienne-Pascal, Lopez‐Bellido, Raphael, Seidenglanz, Marek, Marinkovic, Jelena, Colella, Stefano, Brunel, Brigitte, Young, Peter, Lepetit, Marc
Přispěvatelé: Laboratoire des symbioses tropicales et méditerranéennes (UMR LSTM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), University of York [York, UK], Evolution des Interactions Plantes-Microorganismes, Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement (LIPME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba], AGRITEC, Institute of Field and Vegetable Crops [Novi Sad], French National Research Agency, ANR-16-CE20-0021,GRaSP,Caractérisation du déterminisme génétique du choix du partenaire symbiotique pour une amélioration de la symbiose fixatrice d'azote chez le pois(2016), European Project: 613551,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2013-7-single-stage,LEGATO(2014), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Biology, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Biosystems and Technology, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Córdoba, Agritec Ltd, Partenaires INRAE
Jazyk: angličtina
Rok vydání: 2020
Předmět:
Zdroj: New Phytologist
New Phytologist, 2020, 226, pp.555-568. ⟨10.1111/nph.16392⟩
New Phytologist, Wiley, 2020, pp.1-14. ⟨10.1111/nph.16392⟩
The New Phytologist
ISSN: 0028-646X
1469-8137
DOI: 10.1111/nph.16392⟩
Popis: Early Access; International audience; Fabeae legumes such as pea and faba bean form symbiotic nodules with a large diversity of soil Rhizobium leguminosarum symbiovar viciae (Rlv) bacteria. However, bacteria competitive to form root nodules (CFN) are generally not the most efficient to fix dinitrogen, resulting in a decrease in legume crop yields. Here, we investigate differential selection by host plants on the diversity of Rlv. A large collection of Rlv was collected by nodule trapping with pea and faba bean from soils at five European sites. Representative genomes were sequenced. In parallel, diversity and abundance of Rlv were estimated directly in these soils using metabarcoding. The CFN of isolates was measured with both legume hosts. Pea/faba bean CFN were associated to Rlv genomic regions. Variations of bacterial pea and/or faba bean CFN explained the differential abundance of Rlv genotypes in pea and faba bean nodules. No evidence was found for genetic association between CFN and variations in the core genome, but variations in specific regions of the nod locus, as well as in other plasmid loci, were associated with differences in CFN. These findings shed light on the genetic control of CFN in Rlv and emphasise the importance of host plants in controlling Rhizobium diversity.
Databáze: OpenAIRE
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