Phenogenotypic characterization of Staphylococcus sciuri group and oxacillin-resistance analysis in isolates from rodents ande quines of Army Biologic Institute

Autor: Silva, Amanda Couto Calazans
Přispěvatelé: Souza, Miliane Moreira Soares de, Coelho, Shana de Mattos de Oliveira
Jazyk: portugalština
Rok vydání: 2013
Předmět:
Zdroj: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRRJ
Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)
instacron:UFRRJ
Popis: Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2020-04-20T18:42:49Z No. of bitstreams: 1 2013 - Amanda Couto Calazans Silva.pdf: 1010184 bytes, checksum: b379be07203c74be0a15486ca47041dc (MD5) Made available in DSpace on 2020-04-20T18:42:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013 - Amanda Couto Calazans Silva.pdf: 1010184 bytes, checksum: b379be07203c74be0a15486ca47041dc (MD5) Previous issue date: 2013-03-15 CAPES - Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior Oxacillin/methicillin-resistance in Staphylococcus is related to the integration of SSCmec, containing the mec complex, in the bacterial chromosome. The mecA gene codifies a variant of PBP2, termed PBP2a or PBP2?, whose affinity with the beta-lactamic antibiotics is very low. Complex mec contains mecA and its regulatory genes mecR1 and mecI. Its origin is still unknown, although evidences support that it is related to coagulase-negative staphylococci, once mecA and a homologue gene, pbpD, were both detected in Staphylococcus sciuri species group. The present work evaluated 210 samples of skin and ear swabs from rodents and 60 nasal swabs from equines of Army Biologic Institute, Rio de Janeiro. Pheno- and genotypic results were concordant for 59,52% (25/42) and 78,57% (11/14) S. lentus and S. sciuri isolates, respectively. The phenotypic antimicrobial resistance pattern was evaluated and correlated to the detection of mecA and pbpD genes. Also, mecA sequences from sciuri group strains were compared to others species in order to evaluate the degree of similarity among them. Although all S. sciuri isolates tested positive for pbpD, no correlation was observed with antimicrobial resistance for isolates that presented only mecA homologue On the other hand, isolates tested positive for mecA gene also presented phenotypic resistance in at least one assay. The alignment of the mecA gene showed that the nucleotide sequences were sorted into 2 different groups, one comprising the bovine strains and the other containing human and equine strains. A resist?ncia ? oxacilina em Staphylococcus ? decorrente da integra??o do SSCmec, onde est? localizado o gene mecA, no cromossomo bacteriano. Este gene codifica uma variante da PBP2, a PBP2a, de baixa afinidade a penicilina. O complexo mec ? tamb?m composto pelos genes mecR1 e mecI, com atividade repressora e anti-repressora, respectivamente, sobre o gene mecA. A origem do gene mecA ? desconhecida, por?m, estudos sugerem que sua fonte est? relacionada com Staphylococcus coagulase-negativo, uma vez que a presen?a de mecA e um gene hom?logo denominado pbpD foi detectada em isolados de Staphylococcus sciuri. O presente estudo avaliou 210 amostras de pele e conduto auditivo externo de camundongos e 60 swabs nasais de equinos saud?veis provenientes do Biot?rio e da Fazenda Modelo Gericin?, ambos do Instituto de Biologia do Ex?rcito, localizados no munic?pio do Rio de Janeiro. Resultados feno e genot?picos foram concordantes para 59,52% (25/42) e 78,57% (11/14) para S. lentus e S. sciuri, respectivamente. Foi analisado o fen?tipo de resist?ncia antimicrobiana e correlacionado com a detec??o dos genes mecA e pbpD, em seguida, foi avaliada a similaridade entre as sequ?ncias do gene mecA detectado nas esp?cies do Grupo sciuri com o gene presente em Staphylococcus aureus resistentes ? meticilina. Todos os isolados S. sciuri apresentaram o hom?logo do gene mecA, sem qualquer express?o fenot?pica de resist?ncia ? oxacilina. Por outro lado, os isolados que possu?am o gene mecA apresentaram resist?ncia fenot?pica em pelo menos um dos antibi?ticos testados. O alinhamento do gene mecA mostrou que as sequ?ncias de nucle?tidos foram agrupados em dois grupos diferentes, um oriundo de amostras bovinas e outro de amostras humanas e equinas.
Databáze: OpenAIRE
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