Обнаружение, особенности циркуляции и разнообразие парэховирусов человека в Нижнем Новгороде
| Jazyk: | ruština |
|---|---|
| Rok vydání: | 2013 |
| Předmět: | |
| Zdroj: | Вопросы вирусологии. |
| ISSN: | 2411-2097 0507-4088 |
| Popis: | Проведено исследование 5230 проб копроматериала от детей в возрасте до 17 лет с диагнозом острой кишечной инфекции (ОКИ), госпитализированных в Нижнем Новгороде в 2006-2010 гг. Парэховирусы человека (ПЭВ) выявляли на протяжении всего периода исследований, в среднем с частотой 6,16%, преимущественно (65,83%) в группе детей до 3 лет. Тип вируса методом секвенирования VP3-VP1 области генома идентифицирован в 71 случае: ПЭВ1 (91,55%), ПЭВ6 (5,63%), ПЭВ3 (3,08%) и ПЭВ4 (1,54%). Большинство ПЭВ1 принадлежали к генотипу В, ПЭВ1 генотипа А идентифицированы в единичных случаях. Шесть штаммов ПЭВ1, последовательности которых образовали самостоятельную филогенетическую группу и имели не более 88% гомологии с известными последовательностями ПЭВ генотипов 1А и 1В, могут быть охарактеризованы как представители отдельного генотипа ПЭв1. A total of 5230 specimens from children with gastroenteritis collected in Nizhny Novgorod in 2006-2010 were screened for human parechoviruses (HPeV). HPeV were observed every year with mean frequency of 6.16%. The majority of HpeV (65.83%) was detected in children younger than 3 years. The typing of 71 detected HPeV with the use of partial sequencing of the VP3-VP1 region revealed the presence of HPeV1 (91.55%), HpeV6 (5.63%), HPeV3 (3.08%), HPeV4 (1.54%). HPeV1B was predominant among HPeV1, HPeV1A was identified rarely. Six stains of HPEV1 formed separate phylogenetic cluster, had sequence gomology with HPEV1A or HPeV1B not more than 88% and could be characterized as members of a separate genotype HPeV1. |
| Databáze: | OpenAIRE |
| Externí odkaz: |
|