| Popis: |
Amaç: Aydın ilinde jeotermal tesislerin bulunduğu ve bulunmadığı alanlardan toprak örnekleri alınarak, bakteriyal yükün belirlenmesi, bakteri izolasyonlarının ve tanılamalarının gerçekleştirilmesidir. Materyal ve Yöntem: Bu araştırmada Aydın’da jeotermal tesislerin bulunduğu Germencik, İncirliova, Umurlu, Sultanhisar, Köşk, Pamukören’deki meyve bahçelerinden ve pozitif kontrol olarak jeotermal tesislerin olmadığı Aydın-Çine’den toprak örnekleri alınmıştır. Bu örneklerden izole edilen bakterilerin morfolojik, kültürel ve moleküler tanılamaları yapılmıştır. Bulgular: Araştırma sonucunda izole edilen 60 izolat yoğun olarak Bacillaceae familyasına ait türler tespit edilmiştir. Bacillus cinsine ait 38 adet tür tespit edilmiştir. Ayrıca Chryseobacterium, Dermacoccus, Pseudomonas, Paenarthrobacter, Arthrobacter, Microbacterium cinsleride tespit edilmiştir. Bacillus sp. 9 adet, Bacillus subtilis 6 adet, Bacillus megaterium 4 adet, Bacillus pumilus 4 adet, Lysinibacillus pakistanensis 4 adet, Bacillus aryabhattai 3 adet, Microbacterium foliorum 2 adet, Bacillus wiedmannii 2 adet, diğer bakteri türlerinden de birer adet ve toplamda 60 adet tür bulunmuştur. Sonuç: Jeotermal santrallerinin yakın çevresinden alınan numunelerden elde edilen izotlar ile toprak mikrobiyal yükü belirlenmiştir. Aydın bölgesindeki jeotermal santrallerin çevresindeki toprakta bulunan bakterilerine etkisi ve türlerin isimleri belirlenmiştir. Bu alanda yapılacak benzer çalışmalara referans örneği olabilir. Objective: In this research, a detailed examination of the region located in the geothermal soils in Aydın province was made. Material and Methods: Soil samples were taken from the gardens in Germencik, İncirliova, Umurlu, Sultanhisar, Köşk, Pamukören, where there are geothermal facilities in Aydın, and Aydın-Çine, where there are no geothermal facilities as positive control. Morphological, cultural and molecular identifications of bacteria isolated from these samples were made. Results: As a result of the research, 60 isolates were concentrated in the Bacillaceae family. species have been identified. 38 species belonging to the genus Bacillus were identified. also Chryseobacterium, Dermacoccus, Pseudomonas, Paenarthrobacter, Arthrobacter, It has also been detected in Microbacterium genera. Bacillus sp. 9 species, Bacillus subtilis 6, Bacillus megaterium 4, Bacillus pumilus 4, Lysinibacillus pakistanensis 4, Bacillus aryabhattai 3, Microbacterium foliorum 2, Bacillus wiedmannii 2, one each from other bacterial species and a total of 60 species were found. Conclusion: Soil microbial load was determined with the isodes obtained from the samples taken from the close vicinity of the geothermal power plants. The effects of the geothermal power plants in the Aydın region on the bacteria found in the surrounding soil and the names of the species were determined. It can be a reference example for similar studies in this field. İÇİNDEKİLER KABUL VE ONAY ............................................................................................................iii ÖNSÖZ................................................................................................................................iv ÖZET...................................................................................................................................v ABSTRACT ........................................................................................................................vi ŞEKİLLER DİZİNİ.............................................................................................................xii TABLOLAR DİZİNİ...........................................................................................................xiii SİMGELER VE KISALTMALAR DİZİNİ........................................................................xv 1. GİRİŞ...............................................................................................................................1 1.1. Yenilenebilir Enerji Kaynakları ve Jeotermal Santraller..............................................3 1.2. Türkiye’de Jeotermal Santraller ...................................................................................6 1.3. Dünya’da Jeotermal Santraller .....................................................................................9 1.4. Toprak...........................................................................................................................10 1.4.1. Toprağın Önemi.........................................................................................................11 1.4.2. Toprak Çeşitleri.........................................................................................................11 1.4.2.1. Zonal Topraklar......................................................................................................11 1.4.2.2. Kestane Renkli Topraklar.......................................................................................12 1.4.2.3. Kireçsiz Kahverengi Orman Toprakları .................................................................12 1.4.2.4. Kahverengi Topraklar.............................................................................................12 1.4.2.5. Kahverengi Orman Toprakları................................................................................13 1.4.2.6. Alüvyal Topraklar ..................................................................................................13 1.4.2.7. Kolüvyal Topraklar ................................................................................................13 1.4.2.8. İntrazonal Topraklar...............................................................................................14 1.4.2.9. Rendzinalar.............................................................................................................14 1.4.3. Toprak Kimyasal ve Fiziksel Özellikleri...................................................................14 1.4.3.1. Toprağın Fiziksel Özellikleri..................................................................................14 viii 1.4.3.2. Toprağın Yapısı......................................................................................................14 1.4.3.3. Toprak Strüktürü ....................................................................................................15 1.4.3.4. Toprağın Ağırlığı....................................................................................................15 1.4.3.5. Toprağın Rengi.......................................................................................................16 1.4.3.6. Toprağın Sıcaklığı ..................................................................................................16 1.4.3.7. Toprağın Kimyasal Özellikleri ...............................................................................16 1.4.4. Toprağın Yapısını Etkileyen Faktörler......................................................................18 1.4.4.1. İklim Etkisi .............................................................................................................18 1.4.4.2. Ana Kaya Etkisi......................................................................................................18 1.4.4.3. Zaman Etkisi...........................................................................................................18 1.4.4.4. Yerşekilleri Etkisi...................................................................................................19 1.5. Toprakta Yaşayan Canlı Grupları Önemi ve Etkileşimi...............................................19 1.6. Toprak İçindeki Biyota.................................................................................................19 1.6.1. Toprak Mikro Biyotası ..............................................................................................20 1.7. Kuraklık, Tuzluluk ve Pestisitler..................................................................................20 1.8. Toprak Kirliliğinin Toprak Mikrobiyotası Üzerine Etkileri.........................................21 1.9. Çevresel Etkiler ............................................................................................................21 1.9.1. Endüstriyel Gelişimin Toprak Üzerine Etkileri.........................................................21 1.9.2. İklim Değişikliğine Etkisi..........................................................................................22 1.10. Jeotermaller ve Etkileri...............................................................................................23 1.10.1. Jeotermaller ve İşlevi...............................................................................................23 1.10.2. Jeotermaller ve Çevreye Etkileri .............................................................................25 1.10.3. Jeotermaller ve Yararları .........................................................................................25 1.10.4. Jeotermaller ve Dezavantajları ................................................................................26 1.10.5. Jeotermallerin Atıkları Nelerdir?.............................................................................26 1.11. Dünyada ve Ülkemizdeki Durumu.............................................................................27 ix 1.12. Jeotermal Santrallerin Canlı Organizmalara Etkileri .................................................29 1.13. Aydın İlindeki Jeotermal Santraller............................................................................31 1.13.1. Efeler .......................................................................................................................31 1.13.2. Pamukören...............................................................................................................32 1.13.3. Galip Hoca Germencik ............................................................................................32 1.13.4. Maren.......................................................................................................................33 1.13.5. Dora3 .......................................................................................................................33 1.13.6. Melih........................................................................................................................34 1.13.7. Pamukören 4............................................................................................................34 1.13.8. Pamukören 5............................................................................................................35 1.13.9. Efe 7.........................................................................................................................35 1.13.10. Efe 8.......................................................................................................................35 1.13.11. Ken 3 .....................................................................................................................35 1.13.12. Mehmethan ............................................................................................................36 1.13.13. Deniz......................................................................................................................36 1.13.14. Ken Kipaş..............................................................................................................36 1.13.15. Kerem ....................................................................................................................37 1.13.15. Kubilay ..................................................................................................................37 1.13.16. Efe 6.......................................................................................................................38 1.13.17. Pamukören 2..........................................................................................................38 1.13.18. Pamukören 3..........................................................................................................38 1.13.19. Kuyucak.................................................................................................................39 1.13.20. Dora 4 ....................................................................................................................39 1.13.21. Sultanhisar.............................................................................................................39 1.13.22. Buharkent ..............................................................................................................40 1.13.23. Gümüşköy..............................................................................................................40 x 1.13.24. Karkey Umurlu......................................................................................................41 1.13.25. Umurlu 2................................................................................................................41 1.13.26. Dora2 .....................................................................................................................42 1.13.27. Dora1 .....................................................................................................................42 2. KAYNAK ÖZETLERİ....................................................................................................43 3. MATERYAL...................................................................................................................45 3.1. Yöntem .........................................................................................................................45 3.1.1. İstasyonların Belirlenmesi .........................................................................................45 3.1.2. Toprak Örneklerinin Alınması ..................................................................................45 3.1.3. Toprak Örneklerinin Nem Oranlarının Belirlenmesi.................................................45 3.1.4. Besiyerleri ve Çözeltilerin Hazırlanması...................................................................46 3.1.5. Dilüsyonların Hazırlanması ve İnokulasyonların Yapılması.....................................48 3.1.6. Genel Canlı Sayımı....................................................................................................49 3.1.7. Bakteri İzolasyonlarının Yapılması...........................................................................49 3.1.8. Gram Boyama............................................................................................................50 3.2. Moleküler Tanılama .....................................................................................................50 3.2.1. PCR............................................................................................................................51 3.2.2. PCR Ürünü Jel Görüntüleri .......................................................................................52 3.2.3. PCR Ürünlerinin Saflaştırılması (PCR Clean-Up)....................................................52 3.3. DNA Dizileme Reaksiyonu..........................................................................................52 3.4. DNA Dizileme Ürünlerinin Saflaştırılması ..................................................................53 3.5. DNA Dizi Analizi İşlemi..............................................................................................53 4. BULGULAR ...................................................................................................................54 4.1. İzolatların Morfolojileri................................................................................................54 4.2. Kültürel Özellikler........................................................................................................54 4.3. Gram Boyama...............................................................................................................55 xi 4.4. Toprak Örneklerinin Nem Oranlarının Belirlenmesi....................................................57 4.5. Toplam Canlı Sayısı .....................................................................................................62 4.6. Moleküler Analizler......................................................................................................64 4.6.1. Genomik DNA Analizleri..........................................................................................64 4.6.2. Analizi Yapılan Modeller ve Filogenetik Ağaç Diyagramı.......................................69 4.6.3. Maksimum Olabilirlik yöntemiyle evrimsel analiz...................................................71 5. TARTIŞMA VE SONUÇ................................................................................................72 KAYNAKLAR....................................................................................................................74 BİLİMSEL ETİK BEYANI.................................................................................................82 ÖZGEÇMİŞ.........................................................................................................................83 |
